이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 show-diff 명령입니다.
프로그램:
이름
show-diff - diff 정보 표시(mimmer 패키지의 일부)
개요
쇼-디프 [옵션]
기술
-f diff 정보를 AMOS 기능으로 출력
-h 도움말 정보 표시
-H 헤더를 표시하지 않음
-q 쿼리에 대한 diff 정보 표시
-r 참조에 대한 diff 정보 표시(기본값)
참조 및 쿼리의 각 시퀀스에 대한 구조적 차이점 목록을 출력합니다.
위치별로 정렬됩니다. 참조 시퀀스 R 및 일치하는 쿼리 시퀀스 Q의 경우
차이는 GAP(XNUMX개의 상호 일관된 정렬 사이의 간격), DUP로 분류됩니다.
(중복 삽입), BRK(기타 삽입 시퀀스), JMP(재배열), INV
(역전으로 재배열), SEQ (다른 시퀀스로 재배열). 처음 다섯
출력의 열은 seq ID, 기능 유형, 기능 시작, 기능 끝 및 기능입니다.
길이. 기능 유형에 따라 추가 열이 추가됩니다. 부정적인 기능
길이는 겹치는 인접 정렬 블록을 나타냅니다.
IDR GAP 갭-시작 갭-끝 갭-길이-R 갭-길이-Q 갭-차이
IDR DUP dup-start dup-end dup-length
IDR BRK 간격 시작 간격 끝 간격 길이
IDR JMP 간격 시작 간격 끝 간격 길이
IDR INV 간격 시작 간격 끝 간격 길이
IDR SEQ 간격 시작 간격 끝 간격 길이 이전 순서 다음 순서
위치는 항상 지정된 ID의 시퀀스를 참조합니다. 다섯 번째 열의 합계
(음수 값 무시)는 삽입된 시퀀스의 총량입니다. 다섯 번째 요약
DUP 기능을 제거한 후 열은 전체 고유 삽입 시퀀스입니다. 정렬되지 않음에 유의하십시오.
시퀀스는 계산되지 않으며 추가 "고유" 시퀀스를 나타낼 수 있습니다. 보다
이러한 정렬 중단 기능을 해석하는 방법에 대한 팁은 설명서를 참조하십시오.
onworks.net 서비스를 사용하여 show-diff 온라인 사용
