이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 명령 snp-sites입니다.
프로그램:
이름
snp-sites - 다중 fasta 정렬 파일에서 snp 사이트를 찾습니다.
개요
snp_사이트 [-mvph] [-o output_filename] [입력 파일]
기술
이 응용 프로그램은 다중 fasta 정렬을 취하고 모든 SNP 사이트를 찾은 다음 출력합니다.
다음 형식 중 하나의 SNP 사이트:
멀티 fasta 정렬, VCF, 편안한 필립 형식.
옵션
-m
멀티 fasta 정렬 파일 출력(기본값)
-v
VCF 파일 출력
-p
phylip 파일 출력
-o
출력 파일 이름 지정
-h
이 문서
-V
버전 표시 및 종료
사용 예
snp 사이트 my-alignment.aln
snp 사이트 my-gzipped-alignment.aln.gz
FORMAT OF L' 입력 FILE
입력 파일은 다음과 같아야 합니다.
>참조_시퀀스
aacccggtt
>comparison_sequence
AACCGGTT
>another_comparison_sequence
AACCGCTT
더 많은 예를 보려면 다음을 방문하십시오.
https://github.com/sanger-pathogens/snp_sites/tree/master/tests/data
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 snp-sites 사용
