tqs - 클라우드에서의 온라인

프로그램:

이름

tqs - 트림 품질 Solexa-Illumina 시퀀스

개요

품질 트림 solexa-Illumina 시퀀스는 사용자 정의 임계값을 사용하여 읽습니다.

옵션

-h, --도움말
이 도움말 메시지를 표시하고 종료

-f SEQFILE, --시퀀스 파일=SEQFILE
Illumina 시퀀스 파일 - 1G 게놈 분석기의 출력 형식(_seq.txt):
7 1 255 669
AACCCCCACTCCTACAACGCCATCATTCCCTCGAC

-q QUALFILE, --qual 파일=QUALFILE
1G에서 출력된 모든 Illumina 강도를 포함하는 prb 파일
게놈 분석기(_prb.txt)

-l MER, --length=MER
시퀀스 읽기 길이(예: 시퀀싱 주기 수, 기본값=36)

-t 임계값, --threshold=THRESHOLD
기본 강도 임계값(-40 ~ 40, 기본값=5)

-d DIFF, --차이 = DIFF
최고 강도와 두 번째 최고 강도 사이의 기본 강도 차이(1 ~ 80,
기본값=5)

-c CONSEC, --consec=CONSEC
임계값을 통과하는 연속 염기의 최소 수(기본값=20)

-v, --자세한
Verbose 모드에서 실행됩니다.

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