이것은 최신 릴리스를 Alphafoldv2.3.2.zip으로 다운로드할 수 있는 Alphafold라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks와 함께 Alphafold라는 이 앱을 무료로 다운로드하여 온라인으로 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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알파 폴드
기술
이 패키지는 AlphaFold v2.0의 추론 파이프라인 구현을 제공합니다. CASP14에 등록되어 Nature에 게재된 완전히 새로운 모델입니다. 단순화를 위해 이 문서의 나머지 부분에서 이 모델을 AlphaFold라고 합니다. 이 소스 코드 또는 모델 매개변수를 사용하여 발생한 결과를 공개하는 모든 출판물은 AlphaFold 논문을 인용해야 합니다. 방법에 대한 자세한 설명은 보충 정보를 참조하십시오. 이 Colab 노트북 또는 커뮤니티 지원 버전과 함께 약간 단순화된 AlphaFold 버전을 사용할 수 있습니다. 전체 데이터베이스의 총 다운로드 크기는 약 415GB이고 압축을 풀었을 때의 총 크기는 2.2TB입니다. 다운로드할 수 있는 충분한 하드 드라이브 공간, 대역폭 및 시간이 있는지 확인하십시오. 더 나은 유전자 검색 성능을 위해 SSD를 사용하는 것이 좋습니다.
기능
- AlphaFold를 실행하려면 여러 유전(서열) 데이터베이스가 필요합니다.
- AlphaFold 코드는 Apache 2.0 라이선스에 따라 라이선스가 부여되지만 AlphaFold 매개변수는 비상업적 용도로 사용할 수 있습니다.
- CASP5 동안 사용되었으며 구조 예측 품질에 대해 광범위하게 검증된 14개 모델
- pTM을 생성하도록 미세 조정된 5개의 pTM 모델
- AlphaFold를 실행하는 가장 간단한 방법은 제공된 Docker 스크립트를 사용하는 것입니다.
- 기본적으로 Alphafold는 보이는 모든 GPU 장치를 사용하려고 시도합니다.
프로그래밍 언어
Python
카테고리
이것은 https://sourceforge.net/projects/alphafold.mirror/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 우리의 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
