이것은 최신 릴리스를 bambam-1.4.tgz로 다운로드할 수 있는 BamBam이라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
BamBam이라는 이 앱을 OnWorks와 함께 무료로 다운로드하여 온라인에서 실행하세요.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
밤밤
Ad
기술
BamBam에는 DNA 차세대 시퀀싱 데이터를 분석하기 위한 수많은 도구가 포함되어 있습니다. SNP 및 indel을 호출하고, 대규모 삭제를 식별하고, 매핑된 읽기의 수를 표로 작성하고, 메틸화 분석 등을 수행하기 위한 도구가 제공됩니다.
SAMtools(http://samtools.sourceforge.net/) 및 BAMtools(https://github.com/pezmaster31/bamtools). 또한 다운로드 tarball에 포함된 BioPerl을 사용합니다.
기능
- SNP 및 indel 호출
- 전가 유전자형
- 합의 시퀀스 구축
- 매핑된 읽기 수(RNA-seq)를 표로 작성
- K-평균 클러스터링으로 일배체형 위상 추론
- DNA 메틸화 분석(바이설파이트 시퀀싱)
오디언스 (Audience)
과학/연구
프로그래밍 언어
펄, C++
카테고리
https://sourceforge.net/projects/bambam/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
