์ด๊ฒ์ ์ต์ ๋ฆด๋ฆฌ์ค๋ฅผ caperna-0.5.tar.gz๋ก ๋ค์ด๋ก๋ํ ์ ์๋ CAPE RNA๋ผ๋ Linux ์ฑ์ ๋๋ค. ์ํฌ์คํ ์ด์ ์ฉ ๋ฌด๋ฃ ํธ์คํ ์ ๊ณต์ ์ฒด์ธ OnWorks์์ ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ ์ ์์ต๋๋ค.
CAPE RNA with OnWorks๋ผ๋ ์ด ์ฑ์ ๋ฌด๋ฃ๋ก ๋ค์ด๋ก๋ํ์ฌ ์จ๋ผ์ธ์์ ์คํํ์ธ์.
์ด ์ฑ์ ์คํํ๋ ค๋ฉด ๋ค์ ์ง์นจ์ ๋ฐ๋ฅด์ธ์.
- 1. ์ด ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ PC์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ต๋๋ค.
- 2. ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX์ ์ํ๋ ์ฌ์ฉ์ ์ด๋ฆ์ ์ ๋ ฅํฉ๋๋ค.
- 3. ์ด๋ฌํ ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์์์ ์ด ์์ฉ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ์ ๋ก๋ํฉ๋๋ค.
- 4. ์ด ์น์ฌ์ดํธ์์ OnWorks Linux ์จ๋ผ์ธ ๋๋ Windows ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ ๋๋ MACOS ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ๋ฅผ ์์ํฉ๋๋ค.
- 5. ๋ฐฉ๊ธ ์์ํ OnWorks Linux OS์์ ์ํ๋ ์ฌ์ฉ์ ์ด๋ฆ์ผ๋ก ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX๋ก ์ด๋ํฉ๋๋ค.
- 6. ์์ฉ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ฌ ์ค์นํ๊ณ ์คํํฉ๋๋ค.
์ผ์ดํ RNA
Ad
๊ธฐ์
CAPE RNA๋ miRNA-mRNA ๋ฐํ ๋ฐ์ดํฐ์ ํตํฉ ๋ถ์์ ์ํ ๋ช ๋ น์ค ๋๊ตฌ ํจํค์ง์ ๋๋ค. miRNA-mRNA ์ํธ ์์ฉ ์ํ๋ ์ฌ์ ์ ์๋ ค์ง ์คํ ๊ทธ๋ฃน๊ณผ ๋ฌด๊ดํ๊ฒ ๊ฐ ์ํ์ ํ ๋น๋ฉ๋๋ค. ์ด๋ฌํ ์ํธ ์์ฉ ๋ถ๋ฅ๋ฅผ ์ฌ์ฉํ์ฌ Jaccard-indexes๋ ์คํ ๊ทธ๋ฃน๊ณผ ๋น๊ตํ์ฌ ํ ๋น๋ ์ํธ ์์ฉ ์ํ์ ๋ถํฌ๋ฅผ ๊ธฐ๋ฐ์ผ๋ก ์์ธก๋ โโ์ํธ ์์ฉ์ ํ์ง์ ํ๊ฐํ๊ธฐ ์ํด ๊ณ์ฐ๋ฉ๋๋ค. ๋ํ miRNA์ mRNA ๋ฐํ ์ฌ์ด์ ์์ ์๊ด๊ด๊ณ๋ฅผ ๋ถ์ํ ์ ์์ต๋๋ค.
์ค๋์ธ์ค (Audience)
๊ณผํ/์ฐ๊ตฌ
์ฌ์ฉ์ ์ธํฐํ์ด์ค
๋ช ๋ น์ค
ํ๋ก๊ทธ๋๋ฐ ์ธ์ด
ํ
์นดํ ๊ณ ๋ฆฌ
https://sourceforge.net/projects/caperna/์์๋ ๊ฐ์ ธ์ฌ ์ ์๋ ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ ๋๋ค. ์ฐ๋ฆฌ์ ๋ฌด๋ฃ ์ด์ ์ฒด์ ์ค ํ๋์์ ๊ฐ์ฅ ์ฌ์ด ๋ฐฉ๋ฒ์ผ๋ก ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ๊ธฐ ์ํด OnWorks์์ ํธ์คํ ๋์์ต๋๋ค.