이것은 최신 릴리스를 GENIE_src.tar로 다운로드할 수 있는 GENIE(GEne-geNe IntEraction)라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks를 사용하여 GENIE(GEne-geNe IntEraction)라는 이 앱을 무료로 온라인으로 다운로드하고 실행하세요.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
GENIE(유전자 상호작용)
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기술
유전적 연관성 연구에서 유전자-유전자 상호작용은 다수의 SNP가 관련될 때 계산 집약적입니다. 대부분의 최신 중앙 처리 장치(CPU)에는 여러 개의 코어가 있는 반면 그래픽 처리 장치(GPU)에는 수백 개의 코어가 있으며 최근에는 더 빠른 과학 소프트웨어를 구현하는 데 사용되었습니다. 그러나 현재 사용자가 이진 특성에 대한 유전적 상호 작용 분석을 위해 이러한 멀티 코어 장치의 컴퓨팅 성능을 완전히 활용할 수 있게 해주는 유전 분석 소프트웨어 패키지는 없습니다.
여기서 우리는 상호 작용 분석을 병렬화하기 위해 여러 GPU 또는 CPU 프로세서 코어의 성능을 활용하는 새로운 소프트웨어 패키지 GENIE를 제시합니다.
인용: Chikkagoudar, S., Wang, K., & Li, M. (2011). GENIE: 다중 GPU 또는 CPU 코어를 사용하는 유전자 연관 연구에서 유전자-유전자 상호 작용 분석을 위한 소프트웨어 패키지입니다. BMC 연구 노트, 4(1), 158.
오디언스 (Audience)
과학/연구
프로그래밍 언어
C
카테고리
이것은 https://sourceforge.net/projects/gpugenie/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
