이것은 kallisto_windows-v0.50.0.zip으로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 kallisto라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks와 함께 kallisto라는 이 앱을 무료로 다운로드하여 온라인에서 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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칼리스토
기술
kallisto는 RNA-Seq 데이터 또는 보다 일반적으로 높은 처리량 시퀀싱 판독을 사용하는 표적 서열의 전사체 양을 거의 최적으로 정량화하기 위한 프로그램입니다. 이는 유사 정렬을 사용하여 정렬할 필요 없이 읽기 및 대상의 호환성을 신속하게 결정한다는 아이디어를 기반으로 합니다.
Mac 데스크톱 컴퓨터에서 수행된 벤치마크에 따르면 kallisto는 읽기 시퀀스와 트랜스크립톰 인덱스만으로 30분 이내에 3천만 개의 인간 벌크 RNA-seq 읽기를 정량화할 수 있으며 자체적으로 빌드하는 데 10분 이상이 걸릴 수 있습니다. 의사 정렬을 사용하기 때문에 읽기 오류에 강하고 정량화에 필요한 주요 정보를 보존합니다. 이로 인해 kallisto는 빠를 뿐만 아니라 매우 정확합니다. 많은 벤치마크에서 기존 도구보다 성능이 훨씬 뛰어납니다.
기능
- 의사정렬 사용
- 빠르고 정확한
- 정량화된 벌크 RNA-Seq는 sleuth로 분석할 수 있습니다.
- 단일 세포 RNA-seq 데이터를 전처리하기 위해 bustools와 함께 사용할 수 있습니다.
프로그래밍 언어
C
카테고리
이것은 https://sourceforge.net/projects/kallisto.mirror/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
