이것은 최신 릴리스가 MarDRe-v1.4.tar.gz로 다운로드될 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 MarDRe라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
MarDRe라는 이름의 이 앱을 온라인으로 다운로드하고 실행하여 무료로 OnWorks와 함께 Linux에서 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
MarDRe, 온라인 Linux에서 실행
설명 :
MarDRe는 FASTQ/FASTA 데이터 세트에서 단일 말단 및 쌍 말단 서열의 클러스터링을 통해 중복 및 거의 중복 DNA 판독을 제거하는 새로운 MapReduce 기반 병렬 도구입니다. 이 도구를 사용하면 생물정보학에서 필요하지 않은 판독의 분석을 피할 수 있어 데이터세트에 대한 후속 절차 시간을 줄일 수 있습니다.MarDRe는 멀티코어 시스템에서 실행 시간을 줄이기 위해 HPC 기술(즉, 하이브리드 MPI/멀티스레딩)을 사용하는 ParDRe(위 링크)의 빅 데이터 대응물입니다. 대신 MarDRe는 MapReduce 프로그래밍 모델을 활용하여 분산 시스템, 특히 클라우드 기반 인프라에서 ParDRe 성능을 크게 향상시킵니다. 플랫폼 간 호환성을 극대화하기 위해 순수 Java로 작성된 MarDRe는 빅 데이터 처리를 위한 가장 널리 사용되는 분산 컴퓨팅 프레임워크인 오픈 소스 Apache Hadoop 프로젝트를 기반으로 합니다.
오디언스 (Audience)
정보 기술, 의료 산업, 과학/연구
사용자 인터페이스
콘솔/터미널, 명령줄
프로그래밍 언어
자바
https://sourceforge.net/projects/mardre/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.