이것은 최신 릴리스를 mica-GPLv3.zip으로 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 MICA-aligner라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
MICA-aligner라는 이 앱을 온라인으로 다운로드하여 실행하면 OnWorks와 함께 Linux 온라인에서 무료로 실행할 수 있습니다.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
Linux 온라인에서 실행되는 MICA 정렬기
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기술
GitHub의 최신 코드:https://github.com/aquaskyline/MICA-aligner
NGS 데이터 분석을 위해 MIC 지원 컴퓨터를 더 잘 활용하기 위해 MIC의 한계와 각 MIC 코어 내부의 추가 병렬성을 고려하여 최적화된 새로운 단독 정렬기 MICA를 개발했습니다. 150bp 페어드 엔드 읽기 정렬에 대한 실험은 하나의 MIC 보드를 사용하는 MICA가 CPU(멀티 코어) 기반 BWA-MEM보다 ~4.85배 빠르고 GPU 기반 SOAP3-dp와 거의 동일한 속도임을 보여줍니다. 또한 MICA의 단순성은 노드에서 여러 MIC 보드를 사용할 때 매우 효율적인 확장을 허용합니다(3개의 카드는 14코어 BWA-MEM보다 6배의 속도 향상을 제공합니다).
오디언스 (Audience)
과학/연구, 교육, 공학
사용자 인터페이스
명령줄
프로그래밍 언어
C + +
데이터베이스 환경
플랫 파일
이것은 https://sourceforge.net/projects/mica-aligner/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
