이것은 최신 릴리스를 mirnaTA_v1.2.3.tar.gz로 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 miRNA Temporal Analyzer(mirnaTA)라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
miRNA Temporal Analyzer(mirnaTA)라는 이 앱을 온라인으로 다운로드하고 실행하여 OnWorks와 함께 Linux 온라인에서 무료로 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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miRNA 시간 분석기(mirnaTA)는 Linux 온라인에서 실행됩니다.
기술
microRNA 시간 분석기(mirnaTA)는 시간 연구에서 차별적으로 발현된 miRNA를 식별하는 데 사용할 수 있는 생물 정보학 도구입니다. Perl 및 R 패키지(>= 2.13.0)에서 구현되며 Linux, Mac 및 Windows와 같은 여러 플랫폼에서 실행할 수 있습니다. mirnaTA는 사용자가 최소 20개의 시점에서 데이터를 제공하고 최대 0.05개의 시점을 분석하도록 요구합니다. 데이터를 정규화하고 기술적 변동성을 제거하기 위해 NQT(Normal Quantile Transformation)를 사용했으며 정규화된 데이터를 선형 회귀 모델을 사용하여 분석하여 선형 방식으로 차등적으로 발현되는 miRNA를 찾습니다. P 값이 1 미만인 모든 miRNA는 통계적으로 유의한 것으로 간주됩니다. 선형 모델에 적합하지 않은 나머지 miRNA는 두 가지 다른 방법으로 추가 분석됩니다: (3) 시점 수가 <2인 경우 정규 분포의 CDF, (3) 시점 수가 >= XNUMX인 경우 ANOVA가 활용됩니다.http://www.gigasciencejournal.com/content/3/1/20
기능
- miRNA 시간 분석기
- 일반 분위수 변환(NQT)
- 최대 20 시점
- R 패키지
- 펄
- 히트 맵
- 실행하기 쉬운
- 그래픽 HTML 인터페이스
- 간단한 출력
오디언스 (Audience)
과학/연구
프로그래밍 언어
펄
이것은 https://sourceforge.net/projects/mirnata/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
