이는 MspJI-seq_pipeline1.0이라는 Linux 앱으로, 최신 릴리스는 파이프라인1.0.tar.gz로 다운로드할 수 있습니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks와 함께 MspJI-seq_pipeline1.0이라는 이 앱을 무료로 다운로드하여 온라인으로 실행해 보세요.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
MspJI-seq_pipeline1.0
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기술
MspJI-seq_pipeline1.0은 DNA 메틸화 연구에서 MspJI 소화 시퀀싱을 위한 파이프라인입니다. 차세대 시퀀싱과 결합된 수정 의존적 제한 엔도뉴클레아제 MspJI 소화는 높은 처리량 읽기를 참조 서열에 매핑함으로써 게놈에서 "CNNR" 사이토신 위치의 메틸화 상태를 추정할 수 있습니다. MspJI-seq_pipeline1.0은 MspJI-seq의 이러한 특수 특성을 처리하기 위한 범용 매핑 프로그램으로 설계되었습니다. 정렬은 오픈 소스 프로그램 SOAP(Short Oligo Alignment Program)를 기반으로 하며 mCNNR 사이트 인식은 perl에서 정규식으로 수행됩니다.
오디언스 (Audience)
과학/연구
프로그래밍 언어
펄
데이터베이스 환경
플랫 파일
카테고리
이것은 https://sourceforge.net/projects/mspjiseqpipelin/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
