이것은 Pathscope_2.0.6_clinical_pathscope_1.0.3.tar.gz로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 Pathscope라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks와 함께 Pathoscope라는 이 앱을 무료로 다운로드하여 온라인에서 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
병리경
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기술
이 페이지는 보관 목적으로 여기에 있습니다. 최신 버전의 소프트웨어는 github를 방문하십시오. https://github.com/pathoscopePathoScope는 혼합물 샘플에서 차세대 시퀀싱 판독을 수행하고 어떤 게놈이 있는지 예측합니다. 초기 참조 기반 정렬과 결합된 베이지안 프레임워크를 사용하여 올바른 기원 게놈에 읽기를 할당합니다.
패스스코프 2.0:
위키 :
http://sourceforge.net/p/pathoscope/wiki/Home/
지도 시간:
http://sourceforge.net/projects/pathoscope/files/pathoscope2.0_v0.02_tutorial.pdf
임상 병리경 버전: http://sourceforge.net/p/pathoscope/wiki/clinical_pathoscope/
PathoQC 다운로드: http://sourceforge.net/projects/pathoscope/files/pathoqc_v0.1.4.tar.gz/download
간행물 : http://www.microbiomejournal.com/content/2/1/33
http://www.biomedcentral.com/1471-2105/15/262
http://genome.cshlp.org/content/23/10/1721
지원 :
추신: 질문이 있으시면 bu dot edu의 mani2012로 이메일을 보내주십시오.
기능
- PathoQC: PathoQC는 처리량이 많은 데이터 세트를 위한 품질 관리 및 전처리 독립 실행형 프로그램입니다. 다음에서 PathoQC를 다운로드하십시오. http://sourceforge.net/projects/pathoscope/files/pathoqc_v0.1.4.tar.gz/download
- PathoQC 간행물: http://la-press.com/article.php?article_id=4828
- 지원 : https://groups.google.com/d/forum/pathoscope
- 실습 페이지: http://jlab.bu.edu/software/
이것은 https://sourceforge.net/projects/pathoscope/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
