이것은 최신 릴리스를 PBsQF_Mac.zip으로 다운로드할 수 있는 PB-sQF_BacterialTyping이라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks를 사용하여 PB-sQF_BacterialTyping이라는 앱을 무료로 온라인으로 다운로드하여 실행하세요.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린샷:
PB-sQF_BacterialTyping
설명 :
확률 비닝(Probability Binning) - 시그니처 628차 형태(PB-sQF)는 XNUMX개의 박테리아 라이브러리 게놈 중 하나에 알려지지 않은 서열을 입력하여 가장 작은 테스트 통계를 제공하므로 가장 유사한 라이브러리 균주입니다.
입력 파일은 알려지지 않은 조립된 게놈 서열의 k-mer 수 또는 P. Audano et al.이 개발한 KAnalyze에서 생성한 십진수 형식의 원시 짧은 읽기 파일입니다. (https://sourceforge.net/projects/kanalyze/).
다운로드에는 라이브러리 색인, 라이브러리 이름 및 샘플 미확인 항목이 포함되어 있습니다.
기능
- 라이브러리와 알려지지 않은 k-mer 주파수 간의 테스트 통계 계산
- 박테리아 서열 타이핑
- Windows
- Mac
프로그래밍 언어
Matlab
카테고리
이는 https://sourceforge.net/projects/pb-sqf-bacterialtyping/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 시스템 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.