Linux용 PBSuite 다운로드

이것은 PBSuite_15.8.24.tgz로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 PBSuite라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.

 
 

OnWorks와 함께 PBSuite라는 앱을 무료로 다운로드하여 온라인으로 실행하십시오.

이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.

- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.

- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.

- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.

- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.

- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.

- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.

스크린샷:


PBS Suite


설명 :

이것은 현재 Adam English가 만들고 유지 관리하는 두 개의 프로젝트를 호스팅합니다.

PBJelly - 게놈 업그레이드 도구.
PBHoney - 구조적 변형 발견 도구

둘 다 다운로드에 있는 PBSuite 코드에 포함되어 있습니다.

----- 피비젤리 -----
논문 읽기
http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0047768

PBJelly는 긴 시퀀싱 읽기(예: PacBio RS 읽기 또는 fasta 형식의 긴 454 읽기)를 높은 신뢰도의 드래프트 어셈블에 맞추는 고도로 자동화된 파이프라인입니다. PBJelly는 캡처된 간격을 최대한 많이 채우거나 줄여서 업그레이드된 초안 게놈을 생성합니다.

----- PB허니 -----
논문 읽기
http://www.biomedcentral.com/1471-2105/15/180/abstract

PBHoney는 긴 읽기(즉, 10,000bp 이상)의 높은 매핑 가능성을 활용하도록 설계된 두 가지 변종 식별 접근 방식을 구현합니다. PBHoney는 구조적 변이를 식별하기 위해 읽기 내 불일치와 긴 읽기의 부드럽게 잘린 꼬리를 모두 고려합니다.



기능

  • 게놈 어셈블리
  • 게놈 업그레이드
  • 구조적 변화
  • 조립 평가


오디언스 (Audience)

과학/연구



프로그래밍 언어

Python


카테고리

생명정보학

https://sourceforge.net/projects/pb-jelly/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.



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