이것은 최신 릴리스를 RASP-0.1.tar.gz로 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 RASPnmr이라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
RASPnmr이라는 이 앱을 다운로드하여 온라인으로 실행하면 OnWorks와 함께 Linux 온라인에서 무료로 실행할 수 있습니다.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
Linux 온라인에서 실행되는 RASPnmr
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기술
RASP는 구조 기반 화학적 이동 예측을 사용하여 단백질 NMR 분광법의 백본 공명 할당 문제를 해결합니다. 이를 통해 분광학적으로 까다로운 단백질에 대해서도 최소한의 실험 데이터 세트를 기반으로 매우 정확한 할당을 신속하게 결정할 수 있습니다.RASP는 임의의 기존 삼중 공명 NMR 실험 세트를 기반으로 조립된 입력 스핀 시스템으로 사용됩니다. 독특하게도 RASP는 Cbeta 화학적 이동 정보가 없는 경우에도 광범위한 할당이 가능합니다. 154개 단백질의 테스트 세트에 대해 RASP는 HNCO 및 HNCA 스펙트럼에서 사용할 수 있는 정보만 사용하여 88%의 정확도로 잔류물의 99.7%를 할당합니다.
RASP는 여기에 설명되어 있습니다.
MacRaild 및 Norton(2014) RASP: 단백질 구조에서 신속하고 강력한 백본 화학적 이동 지정. J Biomol NMR doi:10.1007/s10858-014-9813-7
오디언스 (Audience)
과학/연구, 고급 최종 사용자
사용자 인터페이스
명령줄
프로그래밍 언어
Python
이것은 https://sourceforge.net/projects/raspnmr/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
