Name: Linux용 SuRankCo 다운로드
Brand: OnWorks
SKU: 6d82f80ae3c9f6bcf507d7cc52df0031
Availability: OnlineOnly
Rating: 4.50 (1744 reviews)

이것은 surankco_r5.tar.gz로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 SuRankCo라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.

OnWorks가 포함된 SuRankCo라는 앱을 무료로 온라인으로 다운로드하여 실행하세요.

이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.

- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.

- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.

- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.

- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.

- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.

- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.

App 다운로드 우분투에서 실행 페도라에서 실행 Windows Sim에서 실행 MACOS Sim에서 실행

수랭크코

기술

SuRankCo는 차세대 시퀀싱 데이터의 de novo 어셈블리에서 contig에 점수를 매기고 순위를 매기는 기계 학습 기반 소프트웨어입니다. 알려진 참조 게놈과 함께 contig의 정렬로 훈련하고 아직 관련 참조 게놈이 없는 contig의 점수와 순위를 예측합니다.

SuRankCo 및 그 기능에 대한 자세한 내용은 다음을 참조하십시오.

"SuRankCo: de novo 어셈블리에서 Contigs의 감독된 순위"
Mathias Kuhring, Piotr Wojtek Dabrowski, Andreas Nitsche, Bernhard Y. Renard
(http://www.biomedcentral.com/1471-2105/16/240/abstract)

참고: SuRankCo를 사용하기 전에 논문과 readme.txt 파일을 읽는 것이 좋습니다.

2015년 XNUMX월 업데이트:
* BAM 지원을 활성화하기 위한 사소한 변경.
2014년 XNUMX월 업데이트:
* ACE/FASTQ(QUAL) 외에 FASTA/SAM 어셈블리에 대한 지원이 추가되었습니다.
참고: FASTA/SAM 어셈블리의 기능에는 아직 BaseCount, BaseSeqmentCount 및 ContigQualities가 포함되어 있지 않습니다.

오디언스 (Audience)

과학/연구

사용자 인터페이스

명령줄

프로그래밍 언어

자바, S/R

카테고리

생물정보학, 기계학습

https://sourceforge.net/projects/surankco/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.