이것은 TomoJ_Applications-2.8.1-jar-with-dependencies.jar로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 TomoJ라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks와 함께 TomoJ라는 앱을 무료로 다운로드하여 온라인으로 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
토모제이
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기술
TomoJ는 단층 촬영 재구성을 위한 ImageJ 플러그인입니다.
그것은 전자 단층 촬영용으로 설계되었지만 평행 빔을 사용한 모든 획득은 작동해야 합니다.
TomoJ는 3D 재구성(WBP, ART, SIRT, OS-SART, 압축 감지) 전에 틸트 시리즈의 사전 처리 및 등록을 제안합니다.
TomoJ는 Java로 작성되었으며 계산은 다중 스레드이며 CPU 또는 GPU(OpenCL)에서 재구성을 수행할 수 있습니다.
등록은 다음에 설명되어 있습니다.
Journal of Structural Biology: X. 2020, 4권. "전자 단층 촬영을 위한 마커 없는 이미지 정렬 개선" COS Sorzano et al. https://doi.org/10.1016/j.yjsbx.2020.100037.
BMC 바이오인포매틱스. 2009년 27월 10일;124:XNUMX."전자 단층 촬영 틸트 시리즈의 마커 없는 영상 등록." COS Sorzano et al.
재건 부분은 다음에서 설명되었습니다.
BMC 바이오인포매틱스. 2007년 6월 8:288. "TomoJ: 투과 전자 현미경에서 XNUMX차원 재구성을 위한 단층 촬영 소프트웨어."Messaoudi C et al
기능
- 단층 촬영
- 이미지제이
- 틸트 시리즈 정렬
- 3D 재구성
- WBP
- 예술(ART)
- 시르트
- 압축 감지
사용자 인터페이스
자바 스윙
프로그래밍 언어
자바, OpenCL
카테고리
이것은 https://sourceforge.net/projects/tomoj/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 우리의 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.