이것은 최신 릴리스를 VCFExplorer-1.0-Setup.exe로 다운로드할 수 있는 VCF Explorer라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks와 함께 VCF Explorer라는 이 앱을 무료로 다운로드하여 온라인에서 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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VCF 탐색기
기술
비용을 절감하는 고처리량 기술은 수천 개의 전체 게놈으로 구성된 수많은 시퀀싱 프로젝트로 이어졌습니다. 엑솜에서 전체 게놈으로의 패러다임 전환은 출력 파일의 크기를 크게 증가시킵니다. exome 파일을 분석하기 위해 개발된 대부분의 기존 도구는 전체 게놈 연구에서 생성된 대용량 VCF 파일에 적합하지 않습니다. 이 작업에서는 대용량 파일을 처리할 수 있는 변형 분석 소프트웨어인 VCF-Explorer를 제시합니다. 프로그램의 효율적인 메모리 관리와 예비 파싱 단계 제거로 일반 컴퓨터에서 분석을 수행할 수 있습니다. VCF-Explorer는 주석 및 샘플에 대한 다양한 유형의 쿼리를 정의할 수 있는 사용하기 쉬운 환경을 제공합니다. VCF-Explorer는 표준 노트북에서 고급 서버에 이르는 다양한 환경과 컴퓨팅 플랫폼에서 실행할 수 있습니다.
기능
- 사용하기 쉬운 환경
- 효율적인 메모리 관리
- 대용량(전체 게놈) VCF 파일 처리
- 제한된 계산 자원을 가진 개인용 컴퓨터에서 작동 가능
사용자 인터페이스
Qt
프로그래밍 언어
C++, 씨
카테고리
이것은 https://sourceforge.net/projects/vcfexplorer/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
