이것은 FishingCNV_1.5.3.zip으로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 Linux 온라인을 통해 Windows 온라인에서 실행되는 FishingCNV라는 Windows 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
FishingCNV라는 이 앱을 다운로드하고 온라인으로 실행하면 OnWorks를 통해 무료로 Linux를 통해 Windows에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 모든 OS OnWorks 온라인 에뮬레이터를 시작하지만 더 나은 Windows 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Windows OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 애플리케이션을 다운로드하여 설치합니다.
- 7. Linux 배포 소프트웨어 저장소에서 Wine을 다운로드합니다. 설치가 완료되면 앱을 두 번 클릭하여 Wine과 함께 실행할 수 있습니다. 인기 있는 Windows 프로그램 및 게임을 설치하는 데 도움이 되는 Wine을 통한 멋진 인터페이스인 PlayOnLinux를 사용해 볼 수도 있습니다.
Wine은 Linux에서 Windows 소프트웨어를 실행하는 방법이지만 Windows가 필요하지 않습니다. Wine은 모든 Linux 데스크탑에서 직접 Windows 프로그램을 실행할 수 있는 오픈 소스 Windows 호환성 계층입니다. 본질적으로 Wine은 Windows가 필요하지 않고 모든 Windows 응용 프로그램을 실행할 수 있도록 Windows를 처음부터 충분히 다시 구현하려고 합니다.
스크린 샷
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FishingCNV는 Linux 온라인을 통해 Windows 온라인에서 실행됩니다.
기술
McGill University에서 개발한 소프트웨어 도구인 FishingCNV는 처리량이 많은 엑솜 시퀀싱 데이터에서 희귀 복제 수 변이를 포괄적으로 분석하기 위한 도구입니다. 입력은 GATK(Genome Analysis ToolKit)에서 생성한 표준 커버리지 파일이고 출력은 추정 CNV를 포함하는 파일입니다.이 프로그램은 2개의 다른 릴리스로 제공됩니다.
* GUI 버전 (FishingCNV_X.XXzip)
* 명령줄 버전(FishingCNV_X.X_pipeline)
파일을 탐색하여 다른 릴리스를 찾으십시오.
기능
- 그래픽 사용자 인터페이스
- 일치하는 테스트/대조군(예: 암/종양)에 대한 CNV 분석
- 일치하지 않는 샘플에 대한 CNV 분석
- 컨트롤 세트 내 일괄 효과 제거
- 탭으로 구분된 출력은 Excel에서 볼 수 있습니다.
- 추가 출력 파일은 IGV에서 시각화 가능
- 각 염색체에 대한 분포도 및 이상치도
오디언스 (Audience)
과학/연구, 교육
사용자 인터페이스
자바 스윙
프로그래밍 언어
자바, S/R
이것은 https://sourceforge.net/projects/fishingcnv/에서도 가져올 수 있는 응용 프로그램입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
