이것은 최신 릴리스를 gmatoV1.2Build20130106.zip으로 다운로드할 수 있는 Genome Microsatellite Analyzing Tool이라는 Windows 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
Genome Microsatellite Analyzing Tool with OnWorks라는 이 앱을 온라인에서 무료로 다운로드하여 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 모든 OS OnWorks 온라인 에뮬레이터를 시작하지만 더 나은 Windows 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Windows OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 애플리케이션을 다운로드하여 설치합니다.
- 7. Linux 배포 소프트웨어 저장소에서 Wine을 다운로드합니다. 설치가 완료되면 앱을 두 번 클릭하여 Wine과 함께 실행할 수 있습니다. 인기 있는 Windows 프로그램 및 게임을 설치하는 데 도움이 되는 Wine을 통한 멋진 인터페이스인 PlayOnLinux를 사용해 볼 수도 있습니다.
Wine은 Linux에서 Windows 소프트웨어를 실행하는 방법이지만 Windows가 필요하지 않습니다. Wine은 모든 Linux 데스크탑에서 직접 Windows 프로그램을 실행할 수 있는 오픈 소스 Windows 호환성 계층입니다. 본질적으로 Wine은 Windows가 필요하지 않고 모든 Windows 응용 프로그램을 실행할 수 있도록 Windows를 처음부터 충분히 다시 구현하려고 합니다.
스크린 샷
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게놈 현미부수체 분석 도구
기술
점점 더 거대한 전체 게놈(>1G)의 시퀀스 가용성이 증가함에 따라 현재 존재하는 SSR 분석 도구를 능가했습니다. GMATo(Genome-wide Microsatellite Analyzing Tool)는 Perl 스크립트를 기반으로 한 거대한 게놈을 위해 특별히 설계된 게놈 측면에서 모든 길이, 모든 크기 및 포괄적인 통계 분석에서 더 빠른 SSR 마이닝을 위한 새롭고 강력한 프로그램입니다. 원시 fasta 형식의 DNA 시퀀스를 포함하는 하나의 입력 파일만 필요하고 표 형식의 출력 파일은 모든 SSR 유전자좌 정보와 XNUMX개의 생물학자 관심 분류에 대한 통계적 분포를 나열합니다. GMATo는 또한 Java로 스크립팅된 쉬운 그래픽 사용자 인터페이스와 Perl로 된 명령줄 인터페이스를 가지고 있으며 Windows, Linux 및 Mac 등에서 실행됩니다. 소프트웨어 GMATo는 거대한 게놈에서 SSR 특성화를 위한 더 나은 도구입니다.이 논문 인용: Wang X. et al , Bioinformation [2013, 9(10):541-544]
이것은 https://sourceforge.net/projects/gmato/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.