최신 릴리스를 P3BSseq_v3.zip으로 다운로드할 수 있는 Linux 온라인을 통해 Windows 온라인에서 실행하는 P2.1BSseq라는 Windows 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
P3BSseq라는 이 앱을 온라인으로 다운로드하고 실행하여 OnWorks를 사용하여 온라인으로 Linux를 통해 Windows 온라인에서 무료로 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 모든 OS OnWorks 온라인 에뮬레이터를 시작하지만 더 나은 Windows 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Windows OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 애플리케이션을 다운로드하여 설치합니다.
- 7. Linux 배포 소프트웨어 저장소에서 Wine을 다운로드합니다. 설치가 완료되면 앱을 두 번 클릭하여 Wine과 함께 실행할 수 있습니다. 인기 있는 Windows 프로그램 및 게임을 설치하는 데 도움이 되는 Wine을 통한 멋진 인터페이스인 PlayOnLinux를 사용해 볼 수도 있습니다.
Wine은 Linux에서 Windows 소프트웨어를 실행하는 방법이지만 Windows가 필요하지 않습니다. Wine은 모든 Linux 데스크탑에서 직접 Windows 프로그램을 실행할 수 있는 오픈 소스 Windows 호환성 계층입니다. 본질적으로 Wine은 Windows가 필요하지 않고 모든 Windows 응용 프로그램을 실행할 수 있도록 Windows를 처음부터 충분히 다시 구현하려고 합니다.
스크린 샷
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Linux 온라인을 통해 Windows 온라인에서 실행되는 P3BSseq
기술
Bisulfite 시퀀싱(BSseq) 처리는 가장 번거로운 차세대 시퀀싱(NGS) 애플리케이션 중 하나입니다. 일부 BSseq 처리 도구를 사용할 수 있지만 분산되어 있고 수수께끼 매개변수가 필요하며 실행 시간과 메모리 사용량이 많습니다. 우리는 트리밍, 정렬, 주석 달기, 중간 결과 기록, 중아황산염 변환 품질 평가 수행, NIH 표준에 따라 BED 메틸롬 생성 및 보고서 파일을 수행하는 BSseq 판독값의 빠르고 정확한 자동 분석을 위한 병렬 처리 파이프라인인 P3BSseq를 개발했습니다. P3BSseq는 실행 시간, 컴퓨터 하드웨어 요구 사항과 관련하여 알려진 BSseq 매퍼보다 성능이 뛰어납니다. 우리는 방향성 및 비방향성 라이브러리 모두와 Whole Genome 및 Reduced Representation BSseq의 싱글 엔드 및 페어드 엔드 읽기 모두에 대해 P3BSseq 매개변수를 최적화했습니다. P3BSseq는 BSseq 업스트림 분석을 위한 사용자 친화적인 간소화된 솔루션으로, 기본 컴퓨터 및 NGS 지식만 있으면 됩니다.기능
- 차세대 시퀀싱(NGS) 데이터 처리
- DNA 메틸로믹스 분석
- 병렬 처리
- RRBS(Bisulfite Sequencing)의 감소된 표현
오디언스 (Audience)
과학/연구
사용자 인터페이스
콘솔/터미널
프로그래밍 언어
Python
이것은 https://sourceforge.net/projects/p3bsseq/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
