ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ bp_hmmer_to_tablep ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
bp_hmmer_to_table - ປ່ຽນຜົນຜະລິດ HMMER ໃຫ້ເປັນຮູບແບບຕາຕະລາງ
ສະຫຼຸບສັງລວມ
bp_hmmer_to_table [-e evaluefilter] [-b bitscorefilter] [--header] [-o outfile] inputfile1 inputfile2 ...
ລາຍລະອຽດ
ຕົວເລືອກແຖວຄໍາສັ່ງ:
-e/--evaluue evaluue -- ກັ່ນຕອງຕາມຄ່າ
-b/--bitscore bitscore -- ການກັ່ນຕອງໂດຍ bitscore
--header -- ທຸງ boolean ເພື່ອພິມສ່ວນຫົວຖັນ
-o/--out -- ທາງເລືອກ outputfile ໃນການຂຽນຂໍ້ມູນ,
ຖ້າບໍ່ດັ່ງນັ້ນຈະຂຽນໄປທີ່ STDOUT
-h/--help -- ສະແດງເອກະສານນີ້
ບໍ່ແມ່ນສະຄິບ SearchIO ໃນທາງດ້ານວິຊາການເພາະວ່ານີ້ບໍ່ໄດ້ໃຊ້ອົງປະກອບ Bioperl ໃດໆແຕ່ເປັນ
ເປັນປະໂຫຍດແລະໄວ. ຜົນຜະລິດແມ່ນຜົນຜະລິດຕາຕະລາງ.
query sequence/domain (ເຫຼົ່ານີ້ແມ່ນ flip-flopped ສໍາລັບ hmmsearch / hmmpfam)
ເລີ່ມການສອບຖາມ
ສິ້ນສຸດການສອບຖາມ
ຊື່ໂດເມນ/ລຳດັບ ຫຼືການເຂົ້າເປັນສະມາຊິກ PFAM
ຕີເລີ່ມຕົ້ນ
ຕີທ້າຍ
ຄະແນນ
e-value
ຊື່ໂດເມນ / ລໍາດັບ (ເຫຼົ່ານີ້ແມ່ນ flip-flopped ສໍາລັບ hmmsearch / hmmpfam)
ຜູ້ຂຽນ - Jason Stajich
Jason Stajich jason_at_bioperl-dot-org
ໃຊ້ bp_hmmer_to_tablep ອອນລາຍໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
