ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ cgview ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
cgview - Circular Genome Viewer
ສະຫຼຸບສັງລວມ
cgview [ຕົວເລືອກ] ...
ລາຍລະອຽດ
CGView ແມ່ນຊຸດ Java ສໍາລັບການສ້າງແຜນທີ່ທີ່ມີຄຸນນະພາບສູງ, ສາມາດຂະຫຍາຍໄດ້ຂອງ genomes ວົງ.
ຈຸດປະສົງຕົ້ນຕໍຂອງມັນແມ່ນເພື່ອຮັບໃຊ້ເປັນອົງປະກອບຂອງລໍາດັບທໍ່ຄໍາແນະນໍາ, ເປັນ
ວິທີການສ້າງຜົນຜະລິດສາຍຕາທີ່ເຫມາະສົມສໍາລັບເວັບໄຊຕ໌. ຂໍ້ມູນຄຸນສົມບັດ ແລະການສະແດງຜົນ
ທາງເລືອກແມ່ນໄດ້ສະຫນອງໃຫ້ກັບໂຄງການໂດຍການນໍາໃຊ້ໄຟລ໌ XML, ໄຟລ໌ delimited ແຖບ, ຫຼື NCBI
ໄຟລ໌ ptt. CGView ແປງການປ້ອນຂໍ້ມູນເຂົ້າໄປໃນແຜນທີ່ຮູບພາບ (PNG, JPG, ຫຼື Scalable Vector
ຮູບແບບກຣາບຟິກ), ພ້ອມດ້ວຍປ້າຍກຳກັບ, ຫົວຂໍ້, ນິທານ, ແລະສ່ວນທ້າຍ. ນອກຈາກນັ້ນ
ແຜນທີ່ເບິ່ງເຕັມໃນຕອນຕົ້ນ, ໂຄງການສາມາດສ້າງຊຸດຂອງແຜນທີ່ hyperlinked ສະແດງໃຫ້ເຫັນ
ຂະຫຍາຍມຸມເບິ່ງ. ແຜນທີ່ທີ່ເຊື່ອມຕໍ່ສາມາດໄດ້ຮັບການຄົ້ນຫາໂດຍນໍາໃຊ້ຕົວທ່ອງເວັບໃດຫນຶ່ງ, ເຮັດໃຫ້ໄວ
ການຊອກຫາ genome, ແລະອໍານວຍຄວາມສະດວກໃນການແບ່ງປັນຂໍ້ມູນ. ປ້າຍຄຸນສົມບັດໃນແຜນທີ່ສາມາດເປັນ
hyperlinked ກັບຊັບພະຍາກອນພາຍນອກ, ອະນຸຍາດໃຫ້ແຜນທີ່ CGView ປະສົມປະສານກັບເວັບທີ່ມີຢູ່
ເນື້ອຫາ ຫຼືຖານຂໍ້ມູນຂອງເວັບໄຊ.
OPTIONS
-A ລະບຸຂະໜາດຕົວອັກສອນຂອງປ້າຍກຳກັບ.
-c ລະບຸຖານເພື່ອຢູ່ກາງເມື່ອຊູມ.
-D ລະບຸຂະໜາດຟອນນິທານ.
-d ລະບຸຄວາມຫນາແຫນ້ນຂອງຫມາຍຕິກ, ລະຫວ່າງ 0 ຫາ 1.0. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນ 1.0.
-E ວ່າຈະຝັງຂໍ້ຄວາມທີ່ອີງໃສ່ vector ໃນຜົນໄດ້ຮັບ SVG ຫຼືບໍ່.
-e ບໍ່ລວມເອົາຜົນຜະລິດ SVG ຈາກຊຸດຮູບພາບຫຼືບໍ່.
-f ຮູບແບບຜົນຜະລິດ: PNG, JPG, SVG, ຫຼື SVGZ.
-h ໄຟລ໌ HTML ເພື່ອສ້າງ.
-H ຄວາມສູງຂອງແຜນທີ່.
-i ໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນເພື່ອວິເຄາະ.
-I ບໍ່ວ່າຈະແຕ້ມປ້າຍຢູ່ພາຍໃນຂອງວົງກະດູກສັນຫຼັງ.
-L ຄວາມກວ້າງຂອງນິທານພາຍນອກ.
-o ໄຟລ໌ຮູບພາບທີ່ຈະສ້າງ.
-p ເສັ້ນທາງໄປຫາໄຟລ໌ຮູບພາບໃນໄຟລ໌ HTML ທີ່ສ້າງຂຶ້ນໂດຍໃຊ້ -h ທາງເລືອກ.
-r ວ່າຈະເອົານິທານອອກຫຼືບໍ່.
-R ວ່າຈະເອົາປ້າຍກຳກັບອອກຫຼືບໍ່.
-s ໄດເລກະທໍລີເພື່ອຮັບຊຸດຮູບພາບ.
-S ບໍ່ວ່າຈະອ້າງອີງໃສ່ແຜ່ນສະໄຕລ໌ພາຍນອກຢູ່ໃນຜົນຜະລິດ HTML ຫຼືບໍ່.
-u ບໍ່ວ່າຈະອ້າງອີງໃສ່ overlib.js ໃນຜົນຜະລິດ HTML.
-U ລະບຸຂະໜາດຕົວອັກສອນໄມ້ບັນທັດຕາມລຳດັບ.
-W ຄວາມກວ້າງຂອງແຜນທີ່.
-x ຄ່າຊູມທີ່ແຍກດ້ວຍໝາຍຈຸດສຳລັບຊຸດຮູບພາບ.
-z ປັດໄຈທີ່ຈະຊູມໂດຍ.
ຕົວຢ່າງ
cgview -f png -i cybercell.xml -o my_picture.png -h view_image.html
cgview -i cybercell.xml -s directory_for_series -e ທີ່ແທ້ຈິງ
ໃຊ້ cgview ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
