ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ coverageCount ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
coverageCount - ການນັບການຄຸ້ມຄອງຂອງແຜນທີ່ອ່ານຢູ່ໃນແຕ່ລະສະຖານທີ່ທັງຫມົດ
genome ອ້າງອີງ
ລາຍລະອຽດ
coverageCount ເວີຊັ່ນ 1.5.0-p1
ໂຄງການນີ້ຄິດໄລ່ການຄຸ້ມຄອງຂອງການອ່ານແຜນທີ່ຢູ່ໃນແຕ່ລະສະຖານທີ່ກ່ຽວກັບການ
genome ອ້າງອິງ. ມັນສ້າງໄຟລ໌ຖານສອງສໍາລັບແຕ່ລະໂຄໂມໂຊມໂດຍການສົມທົບກັບ
ລະດັບການຄຸ້ມຄອງເປັນຕົວເລກຈໍານວນເຕັມ 4-bytes.
ການນໍາໃຊ້
ຈຳນວນຄອບຄຸມ [ຕົວເລືອກ] -i -o
ການໂຕ້ຖຽງທີ່ຕ້ອງການ:
-i
ຊື່ຂອງໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນໃນຮູບແບບ SAM ຫຼື BAM.
-o
ຄໍານໍາຫນ້າຂອງໄຟລ໌ຜົນຜະລິດ. ແຕ່ລະໄຟລ໌ຜົນຜະລິດມີຕົວເລກຈໍານວນເຕັມສີ່ໄບຕ໌
ການໂຕ້ຖຽງທາງເລືອກ:
--maxMOp ຈໍານວນສູງສຸດຂອງການດໍາເນີນງານ 'M' ທີ່ອະນຸຍາດໃຫ້ຢູ່ໃນສະຕຣິງ CIGAR.
10 ໂດຍຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ. ທັງ 'X' ແລະ '=' ຖືກປະຕິບັດເປັນ 'M' ແລະການປະຕິບັດ 'M' ທີ່ຕິດກັນແມ່ນ.
ຮວມຢູ່ໃນສາຍ CIGAR.
coverageCount ເວີຊັ່ນ 1.5.0-p1
ໂຄງການນີ້ຄິດໄລ່ການຄຸ້ມຄອງຂອງການອ່ານແຜນທີ່ຢູ່ໃນແຕ່ລະສະຖານທີ່ກ່ຽວກັບການ
genome ອ້າງອິງ. ມັນສ້າງໄຟລ໌ຖານສອງສໍາລັບແຕ່ລະໂຄໂມໂຊມໂດຍການສົມທົບກັບ
ລະດັບການຄຸ້ມຄອງເປັນຕົວເລກຈໍານວນເຕັມ 4-bytes.
ການນໍາໃຊ້
ຈຳນວນຄອບຄຸມ [ຕົວເລືອກ] -i -o
ການໂຕ້ຖຽງທີ່ຕ້ອງການ:
-i
ຊື່ຂອງໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນໃນຮູບແບບ SAM ຫຼື BAM.
-o
ຄໍານໍາຫນ້າຂອງໄຟລ໌ຜົນຜະລິດ. ແຕ່ລະໄຟລ໌ຜົນຜະລິດມີຕົວເລກຈໍານວນເຕັມສີ່ໄບຕ໌
ການໂຕ້ຖຽງທາງເລືອກ:
--maxMOp ຈໍານວນສູງສຸດຂອງການດໍາເນີນງານ 'M' ທີ່ອະນຸຍາດໃຫ້ຢູ່ໃນສະຕຣິງ CIGAR.
10 ໂດຍຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ. ທັງ 'X' ແລະ '=' ຖືກປະຕິບັດເປັນ 'M' ແລະການປະຕິບັດ 'M' ທີ່ຕິດກັນແມ່ນ.
ຮວມຢູ່ໃນສາຍ CIGAR.
ໃຊ້ coverageCount ອອນໄລນ໌ ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net