fastq_masker - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ໂຄງການ:

NAME

fastq_masker - ໜ້າກາກ nucleotides ທີ່ມີ 'N' (ຫຼືລັກສະນະອື່ນໆ) ອີງຕາມຄຸນນະພາບ

ລາຍລະອຽດ

ການນໍາໃຊ້: fastq_masker [-h] [-v] [-q N] [-r C] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] ສ່ວນຂອງ FASTX
ຊຸດເຄື່ອງມື 0.0.14 ໂດຍ A. Gordon ([email protected])

[-h] = ຫນ້າ​ຈໍ​ການ​ຊ່ວຍ​ເຫຼືອ​ທີ່​ເປັນ​ປະ​ໂຫຍດ​ນີ້​.

[-q N] = ເກນຄຸນນະພາບ - nucleotides ທີ່ມີຄຸນນະພາບຕ່ໍາຈະຖືກ masked

ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນ 10.

[-r C] = ແທນ nucleotides ຄຸນນະພາບຕໍ່າດ້ວຍຕົວອັກສອນ C. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນ 'N'

[-z] = ບີບອັດຜົນຜະລິດດ້ວຍ GZIP.

[-i INFILE]
= FASTQ ໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນ STDIN.

[-o OUTFILE] = ໄຟລ໌ຜົນຜະລິດໄວ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນ STDOUT. [-v] = verbose -
ລາຍ​ງານ​ຈໍາ​ນວນ​ຂອງ​ລໍາ​ດັບ​.

ຖ້າ [-o] ຖືກລະບຸ,
ລາຍງານຈະຖືກພິມເປັນ STDOUT.

ຖ້າ [-o] ບໍ່ໄດ້ຖືກລະບຸ (ແລະຜົນໄດ້ຮັບໄປຫາ STDOUT), ລາຍງານຈະຖືກພິມອອກໃສ່
STDERR.

ໃຊ້ fastq_masker ອອນລາຍໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net