fuzztrane - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ໂຄງການ:

NAME

fuzztran - ຄົ້ນຫາຮູບແບບໃນລໍາດັບທາດໂປຼຕີນ (ແປ)

ສະຫຼຸບສັງລວມ

fuzztran - ລໍາດັບ seqall - ຮູບແບບ ຮູບແບບ [-Frame ບັນຊີລາຍຊື່] [- ຕາ​ຕະ​ລາງ​ ບັນຊີລາຍຊື່] -outfile ບົດ​ລາຍ​ງານ

fuzztran -ຊ່ວຍ

ລາຍລະອຽດ

fuzztran ແມ່ນໂຄງການເສັ້ນຄໍາສັ່ງຈາກ EMBOSS ("The European Molecular Biology Open
Software Suite”). ມັນເປັນສ່ວນຫນຶ່ງຂອງກຸ່ມຄໍາສັ່ງ "Nucleic: Motifs, Protein: Motifs".

OPTIONS

ການປ້ອນຂໍ້ມູນ ສ່ວນ
- ລໍາດັບ seqall

- ຮູບແບບ ຮູບແບບ
ລະຫັດ IUPAC ມາດຕະຖານຕົວອັກສອນດຽວສໍາລັບອາຊິດ amino ແມ່ນຖືກນໍາໃຊ້. ສັນຍາລັກ 'x' ແມ່ນ
ໃຊ້ສໍາລັບຕໍາແຫນ່ງທີ່ອາຊິດ amino ໃດຖືກຍອມຮັບ. ຄວາມບໍ່ແນ່ນອນແມ່ນຊີ້ໃຫ້ເຫັນໂດຍ
ລາຍຊື່ອາຊິດ amino ທີ່ຍອມຮັບໄດ້ສໍາລັບຕໍາແຫນ່ງທີ່ກໍານົດ, ລະຫວ່າງວົງເລັບສີ່ຫຼ່ຽມ '[
]'. ຕົວຢ່າງ: [ALT] ຫຍໍ້ມາຈາກ Ala ຫຼື Leu ຫຼື Thr. ຄວາມບໍ່ແນ່ນອນຍັງຊີ້ໃຫ້ເຫັນໂດຍ
ລາຍຊື່ລະຫວ່າງຄູ່ຂອງວົງເລັບ curly '{ }' ອາຊິດ amino ທີ່ບໍ່ໄດ້ຮັບການຍອມຮັບ
ໃນ​ຕໍາ​ແຫນ່ງ​ທີ່​ກໍາ​ນົດ​ໄວ້​. ຕົວຢ່າງ: {AM} ຫຍໍ້ມາຈາກອາຊິດອາມິໂນໃດໆ ຍົກເວັ້ນ Ala ແລະ Met.
ແຕ່ລະອົງປະກອບຢູ່ໃນຮູບແບບແມ່ນແຍກອອກຈາກເພື່ອນບ້ານດ້ວຍ '-'. (ທາງເລືອກໃນ
fuzztran) ການຊໍ້າຄືນຂອງອົງປະກອບຂອງຮູບແບບສາມາດຊີ້ບອກໄດ້ໂດຍການປະຕິບັດຕາມນັ້ນ
ອົງປະກອບທີ່ມີຄ່າຕົວເລກ ຫຼືໄລຍະຕົວເລກລະຫວ່າງວົງເລັບ. ຕົວຢ່າງ:
x(3) ເທົ່າກັບ xxx, x(2,4) ເທົ່າກັບ xx ຫຼື xxx ຫຼື xxxx. ເມື່ອ ກ
ຮູບ​ແບບ​ແມ່ນ​ຈໍາ​ກັດ​ບໍ່​ວ່າ​ຈະ N- ຫຼື C-terminal ຂອງ​ລໍາ​ດັບ​, ຮູບ​ແບບ​ນັ້ນ​
ເລີ່ມຕົ້ນດ້ວຍສັນຍາລັກ '<' ຫຼືຕາມລໍາດັບລົງທ້າຍດ້ວຍສັນຍາລັກ '>'. ໄລຍະເວລາສິ້ນສຸດ
ຮູບແບບ. (ທາງເລືອກໃນ fuzztran). ຕົວຢ່າງ, [DE](2)HS{P}X(2)PX(2,4)C

ເພີ່ມເຕີມ ສ່ວນ
-Frame ບັນຊີລາຍຊື່
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1

- ຕາ​ຕະ​ລາງ​ ບັນຊີລາຍຊື່

ຜົນຜະລິດ ສ່ວນ
-outfile ບົດ​ລາຍ​ງານ

ໃຊ້ fuzztrane ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net