ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ garniere ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍສະຖານີເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
garnier - ຄາດຄະເນໂຄງສ້າງຮອງຂອງທາດໂປຼຕີນໂດຍໃຊ້ວິທີການ GOR
ສະຫຼຸບສັງລວມ
garnier - ລໍາດັບ seqall -idc integer -outfile ບົດລາຍງານ
garnier -ຊ່ວຍ
ລາຍລະອຽດ
garnier ແມ່ນໂຄງການເສັ້ນຄໍາສັ່ງຈາກ EMBOSS ("The European Molecular Biology Open
Software Suite”). ມັນເປັນສ່ວນຫນຶ່ງຂອງກຸ່ມຄໍາສັ່ງ "Protein: 2D Structure".
OPTIONS
ການປ້ອນຂໍ້ມູນ ສ່ວນ
- ລໍາດັບ seqall
ແບບພິເສດ ສ່ວນ
-idc integer
ໃນເຈ້ຍຂອງພວກເຂົາ, GOR ກ່າວເຖິງວ່າຖ້າທ່ານຮູ້ບາງສິ່ງບາງຢ່າງກ່ຽວກັບໂຄງສ້າງຂັ້ນສອງ
ເນື້ອໃນຂອງທາດໂປຼຕີນທີ່ທ່ານກໍາລັງວິເຄາະ, ທ່ານສາມາດເຮັດໄດ້ດີກວ່າໃນການຄາດຄະເນ. 'idc' ເປັນ
ດັດສະນີເຂົ້າໄປໃນຊຸດຂອງອາເລ, dharr[] ແລະ dsarr[], ເຊິ່ງສະຫນອງ 'ຄ່າຄົງທີ່ການຕັດສິນໃຈ'
(dch, dcs), ຊຶ່ງເປັນການຊົດເຊີຍທີ່ຖືກນໍາໃຊ້ກັບນ້ໍາຫນັກສໍາລັບ helix ແລະແຜ່ນ
(ຂະຫຍາຍ) ເງື່ອນໄຂ. ດັ່ງນັ້ນ, idc=0 ເວົ້າວ່າບໍ່ໃຊ້ການຕັດສິນໃຈຄົງທີ່ offsets, ແລະ idc=1 ຫາ 6.
ຊີ້ໃຫ້ເຫັນວ່າການປະສົມປະສານຕ່າງໆຂອງ dch,dcs offsets ຄວນຖືກນໍາໃຊ້.
ຜົນຜະລິດ ສ່ວນ
-outfile ບົດລາຍງານ
ໃຊ້ garniere ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net