ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ gmx-trjcat ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
gmx-trjcat - ສົມທົບໄຟລ໌ trajectory
ສະຫຼຸບສັງລວມ
gmx trjcat [-f [<.xtc/.trr/...> [... ]] [-n [<.ndx>]] [-demux [<.xvg>]]
[-o [<.xtc/.trr/...> [... ]] [- ເຈົ້າ ] [-xvg ]
[-b ] [-e ] [-dt ] [-[ບໍ່]vel]
[-[ບໍ່]ຕັ້ງເວລາ] [-[ບໍ່]ຄັດ] [-[ບໍ່]ຮັກສາສຸດທ້າຍ]
[-[ບໍ່]ຂຽນທັບ] [-[ບໍ່]ແມວ]
ລາຍລະອຽດ
gmx trjcat concatenates ໄຟລ໌ input trajectory ຫຼາຍໃນລໍາດັບ. ໃນກໍລະນີຂອງສອງ
time frames ຫນຶ່ງໃນໄຟລ໌ຕໍ່ມາຖືກນໍາໃຊ້. ໂດຍການລະບຸ - ຕັ້ງເວລາ ເຈົ້າຈະຖືກຖາມ
ສໍາລັບເວລາເລີ່ມຕົ້ນຂອງແຕ່ລະໄຟລ໌. ໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນຖືກເອົາມາຈາກເສັ້ນຄໍາສັ່ງ, ເຊັ່ນ
ວ່າຄໍາສັ່ງເຊັ່ນ gmx trjcat -f *.trr -o fixed.trr ຄວນເຮັດ trick ໄດ້. ການນໍາໃຊ້ -ແມວ, ທ່ານ
ພຽງແຕ່ສາມາດວາງຫຼາຍໄຟລ໌ຮ່ວມກັນໂດຍບໍ່ມີການເອົາເຟຣມທີ່ມີເວລາດຽວກັນ
ສະແຕມ.
ທາງເລືອກທີ່ສໍາຄັນຫນຶ່ງແມ່ນ inferred ໃນເວລາທີ່ໄຟລ໌ຜົນຜະລິດແມ່ນໃນບັນດາໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນ. ໃນນັ້ນ
ກໍລະນີທີ່ໄຟລ໌ສະເພາະຈະໄດ້ຮັບການຕໍ່ທ້າຍທີ່ຫມາຍຄວາມວ່າທ່ານບໍ່ຈໍາເປັນຕ້ອງເກັບຮັກສາໄວ້
ຈໍານວນຂໍ້ມູນສອງເທົ່າ. ແນ່ນອນ, ໄຟລ໌ທີ່ຈະຕື່ມໃສ່ຈະຕ້ອງເປັນໄຟລ໌ທີ່ຕໍ່າສຸດ
ເວລາເລີ່ມຕົ້ນຕັ້ງແຕ່ອັນໜຶ່ງສາມາດຕໍ່ທ້າຍຢູ່ທ້າຍໄຟລ໌ໃດໜຶ່ງເທົ່ານັ້ນ.
ຖ້າ -demux ທາງເລືອກແມ່ນໄດ້ຮັບ, N trajectories ທີ່ໄດ້ອ່ານ, ແມ່ນລາຍລັກອັກສອນໃນອັນອື່ນ
ຄໍາສັ່ງທີ່ລະບຸໄວ້ໃນ .xvg ແຟ້ມ. ທ .xvg ໄຟລ໌ຄວນມີບາງສິ່ງບາງຢ່າງເຊັ່ນ:
0 0 1 2 3 4 5
2 1 0 2 3 5 4
ຕົວເລກທໍາອິດແມ່ນເວລາ, ແລະຕົວເລກຕໍ່ມາຊີ້ໃຫ້ເຫັນເຖິງຕົວຊີ້ວັດ trajectory. ໄດ້
ເຟຣມທີ່ສອດຄ້ອງກັນກັບຕົວເລກທີ່ມີຢູ່ໃນແຖວທໍາອິດແມ່ນຖືກລວບລວມເຂົ້າໃນ
ເສັ້ນທາງຜົນຜະລິດ. ຖ້າຈໍານວນຂອງເຟຣມໃນ trajectory ບໍ່ກົງກັບວ່າໃນ
.xvg ໄຟລ໌ຫຼັງຈາກນັ້ນໂຄງການພະຍາຍາມທີ່ຈະ smart. ລະວັງ.
OPTIONS
ທາງເລືອກໃນການລະບຸໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນ:
-f [<.xtc/.trr/...> [... ] (traj.xtc)
ເສັ້ນທາງ: xtc tr cpt gro g96 pdb tng
-n [<.ndx>] (index.ndx) (ຖ້າຕ້ອງການ)
ໄຟລ໌ດັດສະນີ
-demux [<.xvg>] (remd.xvg) (ຖ້າຕ້ອງການ)
ໄຟລ໌ xvgr/xmgr
ທາງເລືອກໃນການລະບຸໄຟລ໌ຜົນຜະລິດ:
-o [<.xtc/.trr/...> [... ] (trajout.xtc)
ເສັ້ນທາງ: xtc tr gro g96 pdb tng
ທາງເລືອກອື່ນ:
- ເຈົ້າ (ps)
ຫົວໜ່ວຍສໍາລັບຄ່າເວລາ: fs, ps, ns, us, ms, s
-xvg
xvg ການຈັດຮູບແບບ: xmgrace, xmgr, ບໍ່ມີ
-b (-1)
ຄັ້ງທໍາອິດທີ່ໃຊ້ (ps)
-e (-1)
ໃຊ້ຄັ້ງສຸດທ້າຍ (ps)
-dt (0)
ພຽງແຕ່ຂຽນກອບໃນເວລາທີ່ t MOD dt = ຄັ້ງທໍາອິດ (ps)
-[ບໍ່]vel (ແມ່ນແລ້ວ)
ອ່ານແລະຂຽນຄວາມໄວຖ້າເປັນໄປໄດ້
-[ບໍ່]ຕັ້ງເວລາ (ບໍ່ມີ)
ປ່ຽນເວລາເລີ່ມຕົ້ນແບບໂຕ້ຕອບ
-[ບໍ່]ຄັດ (ແມ່ນແລ້ວ)
ຈັດຮຽງໄຟລ໌ trajectory (ບໍ່ແມ່ນກອບ)
-[ບໍ່]ຮັກສາສຸດທ້າຍ (ບໍ່ມີ)
ຮັກສາກອບທີ່ທັບຊ້ອນກັນໃນຕອນທ້າຍຂອງເສັ້ນທາງ
-[ບໍ່]ຂຽນທັບ (ບໍ່ມີ)
ຂຽນທັບຊ້ອນກັນໃນລະຫວ່າງການຕໍ່ທ້າຍ
-[ບໍ່]ແມວ (ບໍ່ມີ)
ຢ່າປະຖິ້ມກອບເວລາສອງເທົ່າ
ໃຊ້ gmx-trjcat ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
