ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ gt-gff3validator ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
gt-gff3validator - ກວດສອບໄຟລ໌ GFF3 ທີ່ມອບໃຫ້ຢ່າງເຂັ້ມງວດ.
ສະຫຼຸບສັງລວມ
gt gff3validator [ທາງເລືອກ ...] [GFF3_file ...]
ລາຍລະອຽດ
- ກວດສອບຕົວພິມ [string]
ໃຊ້ ontology ທີ່ໃຫ້ໄວ້ໃນໄຟລ໌ OBO ເພື່ອກວດສອບຄວາມສຳພັນຂອງພໍ່ແມ່-ລູກ. ຖ້າບໍ່ມີ
argument ແມ່ນໃຫ້, ໄຟລ໌ sofa.obo ຈາກໄດເລກະທໍລີ gtdata/obo_files ຖືກໃຊ້. ຖ້າ
ການໂຕ້ຖຽງແມ່ນໃຫ້, ມັນຖືກນໍາໃຊ້ເປັນຊື່ໄຟລ໌ OBO. ໃນກໍລະນີທີ່ໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວເຮັດ
ບໍ່ມີຢູ່ .obo ໄດ້ຖືກເພີ່ມເຂົ້າໃນການໂຕ້ຖຽງແລະການໂຫຼດຊື່ໄຟລ໌ຜົນໄດ້ຮັບຈາກ
ພະຍາຍາມໄດເຣັກທໍຣີ gtdata/obo_files. (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່ໄດ້ກໍານົດ)
-xrfcheck [string]
ກວດເບິ່ງຄຸນລັກສະນະ Dbxref ແລະ Ontology_term ສໍາລັບ syntax ທີ່ຖືກຕ້ອງຕາມ a
ໄຟລ໌ຄໍານິຍາມຫຍໍ້. ຖ້າບໍ່ມີການໂຕ້ຖຽງແມ່ນໃຫ້, ໄຟລ໌ GO.xrf_abbs ຈາກ
ໄດເຣັກທໍຣີ gtdata/xrf_abbr ຖືກໃຊ້. ຖ້າການໂຕ້ຖຽງຖືກໃຫ້, ມັນຖືກນໍາໃຊ້ເປັນສະເພາະ
ຊື່ໄຟລ໌ສໍາລັບໄຟລ໌ຫຍໍ້. ໃນກໍລະນີທີ່ໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວບໍ່ມີ,
.xrf_abbr ໄດ້ຖືກເພີ່ມເຂົ້າໃນການໂຕ້ຖຽງແລະການໂຫຼດຊື່ໄຟລ໌ຜົນໄດ້ຮັບຈາກ
ພະຍາຍາມໄດເລກະທໍລີ gtdata/xrf_abbr. (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ບໍ່ໄດ້ກໍານົດ)
-ຊ່ວຍ
ສະແດງການຊ່ວຍເຫຼືອແລະອອກ
-ການປ່ຽນແປງ
ສະແດງຂໍ້ມູນສະບັບແລະອອກ
ການລາຍງານ ບັກ
ລາຍງານບັກຫາ[email protected]>.
ໃຊ້ gt-gff3validator ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
