ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງສຸດທ້າຍ-dotplot ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
Last-dotplot - ສ້າງ dotplot, aka Oxford Grid, ຂອງການຈັດຮຽງໃນຮູບແບບຕາຕະລາງສຸດທ້າຍ
ສະຫຼຸບສັງລວມ
ຈຸດສຸດທ້າຍ - ຊ່ວຍ
ຈຸດສຸດທ້າຍ [ທາງເລືອກໃນການ] maf-or-tab-alignments dotplot.png
ຈຸດສຸດທ້າຍ [ທາງເລືອກໃນການ] maf-or-tab-alignments dotplot.gif
...
ລາຍລະອຽດ
ແຕ້ມຈຸດຂອງການຈັດຮຽງລໍາດັບຄູ່ໃນຮູບແບບ MAF ຫຼືຕາຕະລາງ.
OPTIONS
-h, - ຊ່ວຍ
ສະແດງຂໍ້ຄວາມຊ່ວຍເຫຼືອນີ້ ແລະອອກ
-1 ຮູບແບບ, --seq1=PATTERN
ລໍາດັບທີ່ຈະສະແດງຈາກ genome ທີ 1
-2 ຮູບແບບ, --seq2=PATTERN
ລໍາດັບທີ່ຈະສະແດງຈາກ genome ທີສອງ
-x ກວ້າງ, --ກວ້າງ=WIDTH
ຄວາມກວ້າງສູງສຸດເປັນ pixels (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1000)
-y ຄວາມສູງ, --ຄວາມສູງ=HEIGHT
ຄວາມສູງສູງສຸດເປັນ pixels (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1000)
-f ໄຟລ໌, --fontfile=ເອກະສານ
ໄຟລ໌ຕົວອັກສອນ TrueType ຫຼື OpenType
-s ຂະໜາດ, --fontsize=ຫລືຂະຫຍາຍໂຕ
ຂະໜາດຕົວອັກສອນ TrueType ຫຼື OpenType (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 11)
-c ສີ, --forwardcolor=ສີ
ສີສໍາລັບການຈັດຕັ້ງທາງຫນ້າ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ສີແດງ)
-r ສີ, -- ສີປີ້ນ=ສີ
ສີສໍາລັບການຈັດຕໍາແຫນ່ງປີ້ນ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ສີຟ້າ)
ທາງເລືອກຊ່ອງຫວ່າງທີ່ບໍ່ຕິດຕໍ່ກັນ:
--ຊ່ອງ 1=ເອກະສານ
ອ່ານ genome1 ຊ່ອງຫວ່າງ unsequenced ຈາກ agp ຫຼືໄຟລ໌ gap
--ຊ່ອງ 2=ເອກະສານ
ອ່ານ genome2 ຊ່ອງຫວ່າງ unsequenced ຈາກ agp ຫຼືໄຟລ໌ gap
--bridged-ສີ=ສີ
ສີສໍາລັບຊ່ອງຫວ່າງທີ່ເຊື່ອມຕໍ່ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ສີເຫຼືອງ)
--unbridged-ສີ=ສີ
ສີສໍາລັບຊ່ອງຫວ່າງທີ່ບໍ່ເຊື່ອມໂຍງ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ສີບົວ)
ໃຊ້ last-dotplot ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
