mapMers-depth - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ໂຄງການ:

NAME

mapMers-depth - ລາຍງານຂໍ້ມູນກ່ຽວກັບການສ້າງແຜນທີ່ kmers ກັບລໍາດັບ

ສະຫຼຸບສັງລວມ

ແຜນທີ່ຄວາມເລິກ {- ນ້ ຳ|- ຄວາມ​ເລິກ​|- ສະ​ຖິ​ຕິ​} -mers MERYL -m MERSIZE -seq IN.FSTA

OPTIONS

Modes of ປະຕິບັດງານ
ສໍາລັບລໍາດັບ 's' ແລະຕໍາແຫນ່ງໃນລໍາດັບນັ້ນ 'p':

- ນ້ ຳ ລາຍ​ງານ​ການ​ນັບ (c​) ຂອງ kmer ດຽວ​ທີ່​ເລີ່ມ​ຕົ້ນ​ທີ່​ຕໍາ​ແຫນ່ງ (p​)​.

ຮູບແບບ: 'spc'

- ຄວາມ​ເລິກ​ ລາຍງານຈໍານວນ (n) ຂອງ kmers ທີ່ span ຕໍາແຫນ່ງ (p).

ຮູບແບບ: 'spn'

- ສະ​ຖິ​ຕິ​ ລາຍງານຕໍາ່ສຸດທີ່ (m), ສູງສຸດ (M), ແລະສະເລ່ຍ (a) ຈໍານວນ mers ທັງຫມົດ span
ຕໍາແໜ່ງ (ປ). ຍັງ​ລາຍ​ງານ​ການ​ນັບ​ທັງ​ຫມົດ (t​) ແລະ​ຈໍາ​ນວນ kmers (n​)

ຮູບແບບ: 'spm M atn'

ໂດຍ​ທົ່ວ​ໄປ
-m MERSIZE

-mers MERYL
ເມຣິລ(1) ຖານຂໍ້ມູນ

-seq IN.FSTA
ລໍາດັບການປ້ອນຂໍ້ມູນ fasta

ໃຊ້ mapMers-depth ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net