ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ mia-3dbrainextractT1 ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
mia-3dbrainextractT1 - ສະກັດສະຫມອງຈາກຮູບພາບຫົວ 3D T1 MRI.
ສະຫຼຸບສັງລວມ
mia-3dbrainextractT1 -i -o [ທາງເລືອກ]
ລາຍລະອຽດ
mia-3dbrainextractT1 ໂຄງການນີ້ຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອສະກັດສະຫມອງຈາກຮູບພາບ T1 MR. ມັນທໍາອິດ
ດໍາເນີນການເປັນກຸ່ມ c-ຫມາຍຄວາມວ່າ fuzzy ແລະການແກ້ໄຂ B-field ເພື່ອອໍານວຍຄວາມສະດວກ 3D
ການແບ່ງສ່ວນຂອງຮູບພາບ 3D. ຫຼັງຈາກນັ້ນ, Fiters ຕ່າງໆແມ່ນດໍາເນີນການເພື່ອໃຫ້ໄດ້ບັນຫາສີຂາວ
ການແບ່ງສ່ວນເປັນຫນ້າກາກເບື້ອງຕົ້ນທີ່ຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອດໍາເນີນການພາກພື້ນທີ່ເຕີບໃຫຍ່ເພື່ອໃຫ້ໄດ້ຫນ້າກາກ
ສະຫມອງທັງຫມົດ. ສຸດທ້າຍ, ຫນ້າກາກນີ້ຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອ extact ສະຫມອງຈາກພາກສະຫນາມ B0
ຮູບພາບທີ່ຖືກແກ້ໄຂ.
OPTIONS
-i --in-file=(ການປ້ອນຂໍ້ມູນ, ຕ້ອງການ); ໄອໂອ
ຮູບພາບທີ່ປ້ອນຂໍ້ມູນທີ່ຈະຖືກແບ່ງສ່ວນສໍາລັບປະເພດໄຟລ໌ສະຫນັບສະຫນູນເບິ່ງ
ປລັກອິນ: 3dimage/io
-o --out-file=(ອອກ, ຕ້ອງການ); ໄອໂອ
ຫນ້າກາກສະຫມອງສໍາລັບປະເພດໄຟລ໌ທີ່ສະຫນັບສະຫນູນເບິ່ງ PLUGINS: 3dimage/io
-n --no-of-classes=3
ຈໍານວນຂອງຫ້ອງຮຽນຈໍານວນຂອງຫ້ອງຮຽນ
-w --wm-class=2
index of white matter ດັດຊະນີຂອງສີຂາວ
-p --wm-prob=0.7
ຄວາມເປັນໄປໄດ້ຂອງຄລາສເລື່ອງຂາວສຳລັບການສ້າງໜ້າກາກເບື້ອງຕົ້ນ
ຄວາມເປັນໄປໄດ້ສໍາລັບການສ້າງຫນ້າກາກເບື້ອງຕົ້ນ
-t --grow-threshold=20
ເກນຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນຂອງພາກພື້ນ ເກນຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນຂອງການຂະຫຍາຍຕົວຂອງພາກພື້ນ
--grow-shape=18n
ພື້ນທີ່ຫນ້າກາກໃກ້ຄຽງການຂະຫຍາຍຕົວ
ຊ່ວຍເຫຼືອ & ຂໍ້ມູນ
-V --verbose=ຄຳເຕືອນ
verbosity ຂອງຜົນຜະລິດ, ພິມຂໍ້ຄວາມຂອງລະດັບທີ່ໄດ້ຮັບແລະບູລິມະສິດສູງກວ່າ.
ບຸລິມະສິດທີ່ສະໜັບສະໜູນໂດຍເລີ່ມຈາກລະດັບຕໍ່າສຸດແມ່ນ:
ຂໍ້ມູນ - ຂໍ້ຄວາມໃນລະດັບຕ່ໍາ
trace - Function ໂທຕິດຕາມ
ບໍ່ - ລາຍງານຄວາມລົ້ມເຫຼວຂອງການທົດສອບ
ການເຕືອນໄພ - ຄໍາເຕືອນ
ຄວາມຜິດພາດ - ລາຍງານຄວາມຜິດພາດ
debug - ຜົນຜະລິດແກ້ໄຂບັນຫາ
ຂໍ້ຄວາມ - ຂໍ້ຄວາມປົກກະຕິ
ຄວາມຕາຍ - ລາຍງານຄວາມຜິດພາດຕາຍເທົ່ານັ້ນ
--ລິຂະສິດ
ພິມຂໍ້ມູນລິຂະສິດ
-h --help
ພິມການຊ່ວຍເຫຼືອນີ້
- ? -- ການນໍາໃຊ້
ພິມການຊ່ວຍເຫຼືອສັ້ນ
- ການປ່ຽນແປງ
ພິມຕົວເລກສະບັບແລະອອກ
ການປະມວນຜົນ
--ກະທູ້=-1
ຈໍານວນສູງສຸດຂອງກະທູ້ທີ່ຈະນໍາໃຊ້ສໍາລັບການປຸງແຕ່ງ, ຈໍານວນນີ້ຄວນຈະຕ່ໍາ
ຫຼືເທົ່າກັບຈໍານວນຂອງແກນໂຮງງານຜະລິດຕາມເຫດຜົນໃນເຄື່ອງ. (-1:
ການຄາດຄະເນອັດຕະໂນມັດ).ຈໍານວນສູງສຸດຂອງກະທູ້ທີ່ຈະນໍາໃຊ້ສໍາລັບການປຸງແຕ່ງ, ນີ້
ຈໍານວນຄວນຈະຕ່ໍາຫຼືເທົ່າທຽມກັບຈໍານວນຂອງຫຼັກການປະມວນຜົນທີ່ມີເຫດຜົນໃນ
ເຄື່ອງ. (-1: ການຄາດຄະເນອັດຕະໂນມັດ).
ປລັກອິນ: 3dimage/io
ວິເຄາະ ວິເຄາະພາບ 7.5
ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .HDR, .hdr
ປະເພດອົງປະກອບສະຫນັບສະຫນູນ:
unsigned 8 bit, ເຊັນ 16 bit, ເຊັນ 32 bit, floating point 32 bit,
ຈຸດລອຍ 64 bit
ຖານຂໍ້ມູນ Virtual IO ໄປແລະຈາກສະນຸກເກີຂໍ້ມູນພາຍໃນ
ການຂະຫຍາຍໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .@
ດິຄອມ ຊຸດຮູບພາບ Dicom ເປັນ 3D
ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .DCM, .dcm
ປະເພດອົງປະກອບສະຫນັບສະຫນູນ:
ເຊັນ 16 bit, unsigned 16 bit
hdf5 HDF5 ຮູບ 3D IO
ການຂະຫຍາຍໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .H5, .h5
ປະເພດອົງປະກອບສະຫນັບສະຫນູນ:
ຂໍ້ມູນຖານສອງ, ລົງນາມ 8 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 16 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 16 ບິດ,
ເຊັນ 32 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 32 ບິດ, ເຊັນ 64 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 64 ບິດ, ລອຍ
ຈຸດ 32 ບິດ, ຈຸດລອຍ 64 ບິດ
ອິນເດຍ ຮູບພາບ INRIA
ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .INR, .inr
ປະເພດອົງປະກອບສະຫນັບສະຫນູນ:
ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 16 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 16 ບິດ, ເຊັນ 32
bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64 bit
mhd MetaIO ຮູບພາບ 3D IO ໂດຍໃຊ້ການປະຕິບັດ VTK (ທົດລອງ).
ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .MHA, .MHD, .mha, .mhd
ປະເພດອົງປະກອບສະຫນັບສະຫນູນ:
ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 16 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 16 ບິດ, ເຊັນ 32
bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64 bit
nifti NIFTI-1 ຮູບ 3D IO
ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .NII, .nii
ປະເພດອົງປະກອບສະຫນັບສະຫນູນ:
ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 16 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 16 ບິດ, ເຊັນ 32
bit, unsigned 32 bit, signed 64 bit, unsigned 64 bit, floating point 32
bit, ຈຸດລອຍ 64 bit
vff ຮູບແບບ raster VFF Sun
ການຂະຫຍາຍໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .VFF, .vff
ປະເພດອົງປະກອບສະຫນັບສະຫນູນ:
unsigned 8 bit, ເຊັນ 16 bit
vista ມຸມມອງ 3D
ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .V, .VISTA, .v, .vista
ປະເພດອົງປະກອບສະຫນັບສະຫນູນ:
ຂໍ້ມູນຖານສອງ, ລົງນາມ 8 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 16 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 16 ບິດ,
ເຊັນ 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
Bit
vti ຮູບພາບ 3D VTK-XML ຢູ່ໃນ- ແລະຜົນຜະລິດ (ທົດລອງ).
ການຂະຫຍາຍໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .VTI, .vti
ປະເພດອົງປະກອບສະຫນັບສະຫນູນ:
ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 16 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 16 ບິດ, ເຊັນ 32
bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64 bit
vtk ຮູບພາບ 3D VTK ຂາເຂົ້າ-ຂາອອກ (ການທົດລອງ).
ນາມສະກຸນໄຟລ໌ທີ່ຮັບຮູ້: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage
ປະເພດອົງປະກອບສະຫນັບສະຫນູນ:
ຂໍ້ມູນຖານສອງ, ລົງນາມ 8 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 8 ບິດ, ເຊັນ 16 ບິດ, ບໍ່ໄດ້ເຊັນ 16 ບິດ,
ເຊັນ 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
Bit
EXAMPLE
ສ້າງຫນ້າກາກຈາກຮູບພາບການປ້ອນຂໍ້ມູນໂດຍການແລ່ນການແບ່ງສ່ວນ 5 ຊັ້ນຮຽນຜ່ານຮູບພາບ inpt
input.v ແລະໃຊ້ class 4 ເປັນ white matter class ແລະເກັບຮັກສາຮູບພາບຫນ້າກາກໃນ masked.v ແລະ
B0-field ແກ້ໄຂຮູບພາບໃນ b0.v
mia-3dbrainextractT1 -i input.v -n 5 -w 4 -o masked.v
ຜູ້ຂຽນ
Gert Wollny
COPYRIGHT
ຊອບແວນີ້ແມ່ນລິຂະສິດ (c) 1999-2015 Leipzig, ເຢຍລະມັນແລະ Madrid, ສະເປນ. ມັນມາ
ໂດຍບໍ່ມີການຮັບປະກັນຢ່າງແທ້ຈິງແລະທ່ານສາມາດແຈກຢາຍມັນຄືນໃຫມ່ພາຍໃຕ້ເງື່ອນໄຂຂອງ GNU
ໃບອະນຸຍາດສາທາລະນະທົ່ວໄປສະບັບ 3 (ຫຼືຫຼັງຈາກນັ້ນ). ສໍາລັບຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມດໍາເນີນການໂຄງການທີ່ມີ
ທາງເລືອກ '--ລິຂະສິດ'.
ໃຊ້ mia-3dbrainextractT1 ອອນລາຍໂດຍໃຊ້ການບໍລິການ onworks.net
