ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ primer3_core ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
primer3_core - ອອກແບບ primer ສໍາລັບ PCR
ສະຫຼຸບສັງລວມ
primer3_core [-format_output] [-strict_tags] [ input_file]
ລາຍລະອຽດ
primer3_core ເລືອກ primers ສໍາລັບປະຕິກິລິຍາ PCR, ພິຈາລະນາເປັນເງື່ອນໄຂ oligonucleotide
ອຸນຫະພູມ melting, ຂະຫນາດ, ເນື້ອໃນ GC ແລະຄວາມເປັນໄປໄດ້ primer-dimer, ຂະຫນາດຜະລິດຕະພັນ PCR,
ຂໍ້ຈໍາກັດດ້ານຕໍາແຫນ່ງພາຍໃນລໍາດັບແຫຼ່ງ, ແລະຂໍ້ຈໍາກັດອື່ນໆອື່ນໆ.
ໂດຍຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ, primer3_core ຍອມຮັບການປ້ອນຂໍ້ມູນແລະຜະລິດຜົນຜະລິດໃນຮູບແບບ Boulder-io, pre-XML
ຮູບແບບການປ້ອນຂໍ້ມູນ / ຜົນຜະລິດຂໍ້ຄວາມສໍາລັບຮູບແບບການແລກປ່ຽນຂໍ້ມູນໂຄງການກັບໂຄງການ. ໄດ້
ຮູບແບບ Boulder-io ແລະຄໍາສັ່ງທີ່ primer3_core ເຂົ້າໃຈແມ່ນໄດ້ຖືກອະທິບາຍໄວ້ໃນ
README ໄຟລ໌, ເຊິ່ງຢູ່ໃນລະບົບ Debian ສາມາດພົບເຫັນຢູ່ໃນ /usr/share/doc/primer3/.
OPTIONS
-format_output
ພິມບົດລາຍງານທີ່ເນັ້ນໃສ່ຜູ້ໃຊ້ຫຼາຍຂຶ້ນສໍາລັບແຕ່ລະລໍາດັບ.
-strict_tags
primer3_core ສະທ້ອນແລະບໍ່ສົນໃຈ tags ໃດທີ່ມັນບໍ່ຮັບຮູ້, ເວັ້ນເສຍແຕ່ວ່າ
-strict_tags ທຸງຖືກຕັ້ງຢູ່ໃນບັນທັດຄໍາສັ່ງ, ໃນກໍລະນີ primer3_core ພິມ an
ຂໍ້ຜິດພາດໃນແທັກຜົນຜະລິດ PRIMER_ERROR, ແລະພິມຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມກ່ຽວກັບ stdout;
ຕົວເລືອກນີ້ສາມາດເປັນປະໂຫຍດສໍາລັບລະບົບ debugging ທີ່ລວມເອົາ primer.
ຫມາຍເຫດ
ບໍ່ຮອງຮັບທຸງເກົ່າ -2x_compat ອີກຕໍ່ໄປ.
ອອກ STATUS ລະຫັດ
· 0 ໃນການດໍາເນີນງານປົກກະຕິ.
· -1 ພາຍໃຕ້ເງື່ອນໄຂດັ່ງຕໍ່ໄປນີ້: ການໂຕ້ຖຽງເສັ້ນຄໍາສັ່ງຜິດກົດຫມາຍ, ບໍ່ສາມາດ fflush
stdout, ບໍ່ສາມາດເປີດ (ສໍາລັບການຂຽນແລະການສ້າງ) ໄຟລ໌ .for, .rev ຫຼື .int (ອາດຈະເປັນ.
ເນື່ອງຈາກບັນຫາການປົກປັກຮັກສາ).
· -2 ໃນຄວາມຈໍານອກ.
· -3 ການປ້ອນຂໍ້ມູນຫວ່າງເປົ່າ.
· -4 ຂໍ້ຜິດພາດໃນແທັກການປ້ອນຂໍ້ມູນ "ທົ່ວໂລກ" (ຂໍ້ຄວາມໃນ PRIMER_ERROR).
ການອ້າງອິງ
ກະລຸນາອ້າງເຖິງ Rozen, S., Skaletsky, H. "Primer3 ໃນ WWW ສໍາລັບຜູ້ໃຊ້ທົ່ວໄປແລະສໍາລັບ
ນັກຂຽນໂປລແກລມຊີວະວິທະຍາ." ໃນ S. Krawetz ແລະ S. Misener, eds. ວິທີການຊີວະວິທະຍາແລະ
ອະນຸສັນຍາໃນຊຸດ Methods in Molecular Biology. Humana Press, Totowa, NJ, 2000,
ຫນ້າ 365-386.
ໃຊ້ primer3_core ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
