ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ prodigal ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍສະຖານີເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
prodigal - ໂຄງການຊອກຫາເຊື້ອຈຸລິນຊີ (ເຊື້ອແບັກທີເຣັຍແລະໂບຮານຄະດີ).
ສະຫຼຸບສັງລວມ
ຂອງທີ່ເສຍໄປ [-a trans_file] [-c] [-d nuc_file] [-f output_type] [-g tr_table] [-h] [-i
input_file] [-m] [-n] [-o output_file] [-p mode] [-q] [-s start_file] [-t training_file]
[-v]
ລາຍລະອຽດ
Prodigal (Prokaryotic Dynamic Programming Genefinding Algorithm) ແມ່ນຈຸລິນຊີ (ເຊື້ອແບັກທີເຣັຍ)
ແລະ archaeal) ໂຄງການຊອກຫາ gene ພັດທະນາຢູ່ Oak Ridge National Laboratory ແລະ
ມະຫາວິທະຍາໄລ Tennessee.
OPTIONS
-a: ຂຽນການແປທາດໂປຼຕີນໃສ່ໄຟລ໌ທີ່ເລືອກ.
-c: ປິດທ້າຍ. ຢ່າອະນຸຍາດໃຫ້ genes ແລ່ນອອກຈາກແຄມ.
-d: ຂຽນລໍາດັບ nucleotide ຂອງ genes ໃສ່ໄຟລ໌ທີ່ເລືອກ.
-f: ເລືອກຮູບແບບຜົນຜະລິດ (gbk, gff, ຫຼື sco). ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນ gbk.
-g: ລະບຸຕາຕະລາງການແປທີ່ຈະໃຊ້ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ 11).
-h: ພິມເມນູຊ່ວຍເຫຼືອ ແລະອອກ.
-i: ລະບຸໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນອ່ານຈາກ stdin).
-m: ປະຕິບັດການແລ່ນຂອງ n's ເປັນລໍາດັບຫນ້າກາກແລະບໍ່ສ້າງພັນທຸກໍາໃນທົ່ວພວກມັນ.
-n: ຂ້າມຄູຝຶກ Shine-Dalgarno ແລະບັງຄັບໃຫ້ໂຄງການສະແກນຫາ motifs.
-o: ລະບຸໄຟລ໌ຜົນຜະລິດ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນຂຽນໄປທີ່ stdout).
-p: ເລືອກຂັ້ນຕອນ (ດຽວ ຫຼື meta). ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນແມ່ນດ່ຽວ.
-q: ດໍາເນີນການຢ່າງງຽບໆ (ສະກັດກັ້ນຜົນຜະລິດ stderr ປົກກະຕິ).
-s: ຂຽນພັນທຸກໍາທີ່ມີທ່າແຮງ (ດ້ວຍຄະແນນ) ໃສ່ໄຟລ໌ທີ່ເລືອກ.
-t: ຂຽນເອກະສານການຝຶກອົບຮົມ (ຖ້າບໍ່ມີ); ຖ້າບໍ່ດັ່ງນັ້ນ, ອ່ານແລະນໍາໃຊ້ທີ່ກໍານົດໄວ້
ໄຟລ໌ການຝຶກອົບຮົມ.
-v: ພິມໝາຍເລກສະບັບ ແລະອອກ.
ໃຊ້ການລ່ວງລະເມີດອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
