ນີ້ແມ່ນ sumatra ຄໍາສັ່ງທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນສະຖານີເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຟຣີຫຼາຍອັນຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
sumatra - ການປຽບທຽບໄວແລະແນ່ນອນແລະການຈັດກຸ່ມຂອງລໍາດັບ
ສະຫຼຸບສັງລວມ
ເກາະຊູມາຕຼາ [ທາງເລືອກ] [ຊຸດຂໍ້ມູນ 2]
ລາຍລະອຽດ
ຊູມາຕຼາຄິດໄລ່ຄະແນນ LCS ທີ່ເປັນຄູ່ທັງໝົດ (ລຳດັບຕໍ່ໆມາທີ່ຍາວທີ່ສຸດ) ເປັນໜຶ່ງຄະແນນ
ຊຸດຂໍ້ມູນ nucleotide ຫຼືລະຫວ່າງສອງຊຸດຂໍ້ມູນ nucleotide.
OPTIONS
-h [H]ຊ່ວຍພິມ ຊ່ວຍເຫຼືອ
-l ຄວາມຍາວລຳດັບການອ້າງອີງແມ່ນສັ້ນທີ່ສຸດ.
-L ຄວາມຍາວຂອງລໍາດັບການອ້າງອີງແມ່ນໃຫຍ່ທີ່ສຸດ.
-a ຄວາມຍາວລໍາດັບການອ້າງອີງແມ່ນຄວາມຍາວການຈັດຕໍາແຫນ່ງ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ).
-n ຄະແນນແມ່ນປົກກະຕິໂດຍຄວາມຍາວລໍາດັບອ້າງອີງ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ).
-r ຄະແນນດິບ, ບໍ່ປົກກະຕິ.
-d ຄະແນນແມ່ນສະແດງອອກໃນໄລຍະທາງ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ຄະແນນແມ່ນສະແດງອອກໃນຄວາມຄ້າຍຄືກັນ).
-t ##.##
ເກນຄະແນນ. ຖ້າຄະແນນແມ່ນປົກກະຕິແລະສະແດງອອກໃນຄວາມຄ້າຍຄືກັນ (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ),
ມັນເປັນຕົວຕົນ, ຕົວຢ່າງ 0.95 ສໍາລັບຕົວຕົນຂອງ 95%. ຖ້າຄະແນນແມ່ນປົກກະຕິແລະ
ສະແດງອອກໃນໄລຍະຫ່າງ, ມັນແມ່ນ (1.0 - ຕົວຕົນ), e.g. 0.05 ສໍາລັບຕົວຕົນຂອງ 95%.
ຖ້າຄະແນນບໍ່ປົກກະຕິແລະສະແດງອອກໃນຄວາມຄ້າຍຄືກັນ, ມັນແມ່ນຄວາມຍາວຂອງ
ລຳດັບທົ່ວໄປທີ່ຍາວທີ່ສຸດ. ຖ້າຄະແນນບໍ່ປົກກະຕິແລະສະແດງອອກໃນ
ໄລຍະຫ່າງ, ມັນແມ່ນ (ຄວາມຍາວອ້າງອິງ - ຄວາມຍາວ LCS).
ມີແຕ່ຄູ່ຕາມລຳດັບທີ່ມີຄວາມຄ້າຍຄືກັນຂ້າງເທິງ ##.## ເທົ່ານັ້ນທີ່ພິມອອກ. ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 0.00 (ບໍ່
ເກນ).
-p ## ຈຳນວນກະທູ້ທີ່ໃຊ້ສຳລັບການຄຳນວນ (default=1).
-g n's ຖືກແທນທີ່ດ້ວຍ a's (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ລໍາດັບທີ່ມີ n's ຖືກຍົກເລີກ).
-x ເພີ່ມສີ່ຖັນເພີ່ມເຕີມດ້ວຍການນັບ ແລະຄວາມຍາວຂອງທັງສອງລຳດັບ.
ຊຸດຂໍ້ມູນ 1
(ການໂຕ້ຖຽງທໍາອິດ) ຊຸດຂໍ້ມູນ nucleotide ເພື່ອວິເຄາະ
ຊຸດຂໍ້ມູນ 2
(ການໂຕ້ຖຽງທີສອງ) ເປັນທາງເລືອກຊຸດຂໍ້ມູນ nucleotide ທີສອງ
ຜົນໄດ້ຮັບ
ລາຍລະອຽດຕາຕະລາງຜົນໄດ້ຮັບ
ຖັນທີ 1: ລຳດັບຕົວລະບຸ 1
ຖັນທີ 2: ລຳດັບຕົວລະບຸ 2
ຖັນທີ 3: ຄະແນນ
ຖັນທີ 4 : ຈຳນວນຂອງລຳດັບທີ 1 (ມີທາງເລືອກເທົ່ານັ້ນ -x)
ຖັນທີ 5 : ຈຳນວນຂອງລຳດັບທີ 2 (ມີທາງເລືອກເທົ່ານັ້ນ -x)
ຖັນ 6 : ຄວາມຍາວຂອງລໍາດັບ 1 (ພຽງແຕ່ມີທາງເລືອກ -x)
ຖັນ 7 : ຄວາມຍາວຂອງລໍາດັບ 2 (ພຽງແຕ່ມີທາງເລືອກ -x)
ໃຊ້ sumatra ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
