ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ wordfindere ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
wordfinder - ຈັບຄູ່ລໍາດັບຂະຫນາດໃຫຍ່ຕໍ່ກັບຫນຶ່ງຫຼືຫຼາຍລໍາດັບອື່ນ
ສະຫຼຸບສັງລວມ
wordfinder - ລໍາດັບ seqset - ລໍາດັບ seqall [- ໄຟລ໌ຂໍ້ມູນ ມາຕຣິກເບື້ອງ] -gapopen float
- ຂະຫຍາຍ float [- ກວ້າງ integer] [-wordlen integer] [- ການແຂ່ງຂັນຈໍາກັດ integer]
[- ຂອບເຂດຈໍາກັດ integer] [- ການແຂ່ງຂັນຕ່ໍາ integer] [- ຈັດຕໍາ່ສຸດ integer] -outfile align
[-errorfile outfile]
wordfinder -ຊ່ວຍ
ລາຍລະອຽດ
wordfinder ແມ່ນໂຄງການເສັ້ນຄໍາສັ່ງຈາກ EMBOSS ("The European Molecular Biology Open
Software Suite”). ມັນແມ່ນສ່ວນຫນຶ່ງຂອງກຸ່ມຄໍາສັ່ງ "ຈັດຮຽງ: ທ້ອງຖິ່ນ".
OPTIONS
ການປ້ອນຂໍ້ມູນ ສ່ວນ
- ລໍາດັບ seqset
- ລໍາດັບ seqall
- ໄຟລ໌ຂໍ້ມູນ ມາຕຣິກເບື້ອງ
ນີ້ແມ່ນໄຟລ໌ຕາຕະລາງຄະແນນທີ່ໃຊ້ໃນເວລາປຽບທຽບລໍາດັບ. ໂດຍຄ່າເລີ່ມຕົ້ນມັນແມ່ນ
ໄຟລ໌ 'EBLOSUM62' (ສໍາລັບທາດໂປຼຕີນ) ຫຼືໄຟລ໌ 'EDNAFULL' (ສໍາລັບລໍາດັບ nucleic). ເຫຼົ່ານີ້
ໄຟລ໌ຖືກພົບເຫັນຢູ່ໃນໄດເລກະທໍລີ 'ຂໍ້ມູນ' ຂອງການຕິດຕັ້ງ EMBOSS.
ທີ່ກໍານົດໄວ້ ສ່ວນ
-gapopen float
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: @($(acdprotein)? 30.0 : 30.0)
- ຂະຫຍາຍ float
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: @($(acdprotein)? 1.5 : 1.5)
ເພີ່ມເຕີມ ສ່ວນ
- ກວ້າງ integer
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 16
-wordlen integer
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 6
- ການແຂ່ງຂັນຈໍາກັດ integer
- ຂອບເຂດຈໍາກັດ integer
- ການແຂ່ງຂັນຕ່ໍາ integer
- ຈັດຕໍາ່ສຸດ integer
ຜົນຜະລິດ ສ່ວນ
-outfile align
-errorfile outfile
ໄຟລ໌ຂໍ້ຜິດພາດທີ່ຈະຂຽນເປັນຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: wordfinder.error
ໃຊ້ wordfindere ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
