ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ FusionCatcher ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ fusioncatcher_v1.20.zip. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ FusionCatcher ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
FusionCatcher ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌
Ad
ລາຍລະອຽດ
FusionCatcher ຄົ້ນຫາ genes fusion somatic ນະວະນິຍາຍ / ຮູ້ຈັກ, ການໂອນຍ້າຍ, ແລະ chimeras ໃນຂໍ້ມູນ RNA-seq (paired-end ອ່ານຈາກເວທີ Illumina NGS ເຊັ່ນ Solexa ແລະ HiSeq) ຈາກຕົວຢ່າງທີ່ເປັນພະຍາດ.ຈຸດປະສົງຂອງ FusionCatcher ແມ່ນ:
- ອັດຕາການກວດພົບທີ່ດີທີ່ສຸດສໍາລັບການຊອກຫາເຊື້ອ fusion ຂອງຜູ້ສະຫມັກ,
- ງ່າຍທີ່ຈະນໍາໃຊ້ (ເຊັ່ນ: ບໍ່ມີຄວາມຮູ້ສໍາຄັນຂອງຖານຂໍ້ມູນແລະ bioinformatics ແມ່ນຈໍາເປັນເພື່ອດໍາເນີນການ FusionCatcher),
- ການກວດຫາພັນທຸ ກຳ fusion ທີ່ທ້າທາຍໄດ້ດີຫຼາຍ, ເຊັ່ນ: IGH fusions, CIC fusions, DUX4 fusions, CRLF2 fusions, TCF3 fusions, ແລະອື່ນໆ.
- ເພື່ອໃຫ້ເປັນອັດຕະໂນມັດເທົ່າທີ່ເປັນໄປໄດ້ (ເຊັ່ນ FusionCatcher ຈະເລືອກຕົວກໍານົດທີ່ດີທີ່ສຸດໂດຍອັດຕະໂນມັດເພື່ອຊອກຫາ genes fusion, ເຊັ່ນ: ການຊອກຫາຕົວດັດແປງອັດຕະໂນມັດ, ການສ້າງຈຸດເຊື່ອມຕໍ່ exon-exon ອັດຕະໂນມັດໂດຍອີງໃສ່ຄວາມຍາວຂອງ input ອ່ານ, ແລະອື່ນໆ). ໃນຂະນະທີ່ໃຫ້ອັດຕາການກວດພົບທີ່ດີທີ່ສຸດສໍາລັບການຊອກຫາພັນທຸກໍາ fusion.
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Python
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/fusioncatcher/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
