ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ P3BSseq ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ P3BSseq_v2.1.zip. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ P3BSseq ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
P3BSseq ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌
ລາຍລະອຽດ
ການປະມວນຜົນ Bisulfite sequencing (BSseq) ແມ່ນຢູ່ໃນບັນດາຄໍາຮ້ອງສະຫມັກລໍາດັບການຜະລິດຕໍ່ໄປ (NGS) ທີ່ຫຍຸ້ງຍາກທີ່ສຸດ. ເຖິງແມ່ນວ່າບາງເຄື່ອງມືການປຸງແຕ່ງ BSseq ແມ່ນມີຢູ່, ພວກມັນກະແຈກກະຈາຍ, ຕ້ອງການພາລາມິເຕີທີ່ສັບສົນແລະຕ້ອງການເວລາແລ່ນແລະຄວາມຈໍາ. ພວກເຮົາໄດ້ພັດທະນາ P3BSseq, ທໍ່ການປຸງແຕ່ງຂະຫນານສໍາລັບການວິເຄາະໄວ, ຖືກຕ້ອງແລະອັດຕະໂນມັດຂອງ BSseq ອ່ານວ່າ trims, aligns, annotates, ບັນທຶກຜົນໄດ້ຮັບລະຫວ່າງກາງ, ປະຕິບັດການປະເມີນຄຸນນະພາບການແປງ bisulfite, ສ້າງ BED methylome ແລະໄຟລ໌ລາຍງານຕາມມາດຕະຖານ NIH. P3BSseq ປະຕິບັດແຜນທີ່ BSseq ທີ່ຮູ້ຈັກກ່ຽວກັບເວລາແລ່ນ, ຄວາມຕ້ອງການຂອງຮາດແວຄອມພິວເຕີ. ພວກເຮົາໄດ້ເພີ່ມປະສິດທິພາບພາລາມິເຕີ P3BSseq ສໍາລັບທັງຫ້ອງສະຫມຸດທິດທາງແລະບໍ່ມີທິດທາງ, ແລະສໍາລັບການອ່ານທັງສອງ end-end ແລະ paired-end ຂອງ Whole Genome ແລະການຫຼຸດຜ່ອນການເປັນຕົວແທນ BSseq. P3BSseq ເປັນການແກ້ໄຂສະຫນັບສະຫນູນຜູ້ໃຊ້ເປັນມິດສໍາລັບການວິເຄາະຕົ້ນຕໍ BSseq, ຮຽກຮ້ອງໃຫ້ມີພຽງແຕ່ຄອມພິວເຕີພື້ນຖານແລະຄວາມຮູ້ NGS.ຄຸນລັກສະນະ
- ການປະມວນຜົນຂໍ້ມູນ Next Generation Sequencing (NGS).
- ການວິເຄາະ DNA methylomics
- ການປຸງແຕ່ງຂະຫນານ
- ການຫຼຸດຜ່ອນການເປັນຕົວແທນຂອງລໍາດັບ Bisulfite (RRBS)
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
Console/Terminal
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Python
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/p3bsseq/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
