ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ SmithWaterman ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ smith_waterman-0.2.3.tar.gz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ຊື່ SmithWaterman ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
SmithWaterman ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌
ລາຍລະອຽດ
ຍ້າຍໄປ GITHUB: https://github.com/noporpoise/seq-alignການປະຕິບັດຂັ້ນຕອນການຈັດລໍາດັບທ້ອງຖິ່ນຂອງ Smith-Waterman.
ເບິ່ງການສອດຄ່ອງທົ່ວໂລກຂອງໂຄງການເອື້ອຍຂອງພວກເຮົາໂດຍໃຊ້ Needleman-Wunsch:
http://sourceforge.net/projects/needlemanwunsch/
ຄຸນລັກສະນະ
- ການລົງໂທດຊ່ອງຫວ່າງ affine
- ຜົນຜະລິດສີ
- ອ່ານໄຟລ໌ FASTA, FASTQ ແລະລໍາດັບທໍາມະດາ (inc. gzip'ed files)
- ກຳນົດຄ່າ DNA/Protein ແທນ matrices (PAM/BLOSUM ແລະອື່ນໆ)
- ສາມາດໂຫຼດ matrices ທົດແທນການລົງໂທດ
- ລະຫັດ C Portable ທີ່ສາມາດໃຊ້ໃນໂຄງການ bioinformatics ອື່ນໆ
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ, ການສຶກສາ
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
Console/Terminal, ແຖວຄໍາສັ່ງ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
C++, C
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/smithwaterman/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
