ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ SnowyOwl ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ SnowyOwl-2.0.3.tar.gz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ SnowyOwl ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
SnowyOwl
ລາຍລະອຽດ
SnowyOwl ເປັນທໍ່ການຄາດຄະເນພັນທຸກໍາທີ່ນໍາໃຊ້ຂໍ້ມູນ RNA-Seq ເພື່ອຝຶກອົບຮົມແລະໃຫ້ຄໍາແນະນໍາສໍາລັບການຜະລິດຂອງ Hidden Markov Model (HMM) ການຄາດຄະເນພັນທຸກໍາ, ແລະເພື່ອປະເມີນຮູບແບບຜົນໄດ້ຮັບ. ທໍ່ດັ່ງກ່າວໄດ້ຖືກກວດສອບແລະປັບປຸງໂດຍການປຽບທຽບການຄາດຄະເນຂອງມັນກັບຕົວແບບ gene curated ດ້ວຍຕົນເອງໃນສາມ genomes fungal, ແລະຜົນໄດ້ຮັບຂອງມັນສະແດງໃຫ້ເຫັນເຖິງການເພີ່ມຂຶ້ນຢ່າງຫຼວງຫຼາຍໃນຄວາມອ່ອນໄຫວແລະການຄັດເລືອກຫຼາຍກວ່າການຄາດຄະເນ gene ທີ່ຜ່ານມາ. ຄວາມອ່ອນໄຫວແມ່ນໄດ້ຮັບໂດຍການແລ່ນຕົວຄາດຄະເນ gene HMM ເລື້ອຍໆ Augustus ທີ່ມີຕົວກໍານົດການປ້ອນຂໍ້ມູນທີ່ແຕກຕ່າງກັນ, ແລະການຄັດເລືອກໂດຍການເລືອກແບບຈໍາລອງທີ່ມີ homology ທີ່ດີທີ່ສຸດກັບທາດໂປຼຕີນທີ່ຮູ້ຈັກແລະການຕົກລົງທີ່ດີທີ່ສຸດກັບຂໍ້ມູນ RNA-Seq. SnowyOwl ໄດ້ທຳນາຍຢ່າງສຳເລັດຜົນໃນ 26 genomes ຂອງເຊື້ອເຫັດອັນໃໝ່.
ທໍ່ສາມາດຕິດຕັ້ງຢູ່ໃນທ້ອງຖິ່ນສໍາລັບການສົ່ງຜ່ານສູງແລະຄວບຄຸມການຕັ້ງຄ່າ. ມັນຍັງສາມາດດໍາເນີນການຢູ່ໃນເຄື່ອງແມ່ຂ່າຍຫ່າງໄກສອກຫຼີກໂດຍຜ່ານການໂຕ້ຕອບເວັບໄຊຕ໌ທີ່ສະດວກສໍາລັບການນໍາໃຊ້ບາງຄັ້ງຄາວ.
ຄຸນລັກສະນະ
- ການຄາດຄະເນພັນທຸກໍາໂດຍໃຊ້ຂໍ້ມູນ RNA-Seq
- ມີຄວາມອ່ອນໄຫວສູງແລະມີຄວາມລະອຽດສູງ
- Pipeline ປັບປຸງ ແລະກວດສອບດ້ວຍຕົວແບບ gene ທີ່ຖືກຄັດເລືອກດ້ວຍຕົນເອງ
- ການຕັ້ງຄ່າສູງ
- ການຕັ້ງຄ່າເລີ່ມຕົ້ນສໍາລັບເຊື້ອເຫັດ ascomycete ແລະ basidiomycete
- ຕິດຕັ້ງແລະດໍາເນີນການໃນທ້ອງຖິ່ນສໍາລັບການຄວບຄຸມແລະຄວາມຍືດຫຍຸ່ນ
- ດໍາເນີນການຫ່າງໄກສອກຫຼີກໂດຍຜ່ານການໂຕ້ຕອບເວັບໄຊຕ໌ເພື່ອຄວາມສະດວກ
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ, ຜູ້ໃຊ້ສຸດທ້າຍຂັ້ນສູງ
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
ອີງໃສ່ເວັບ, ເສັ້ນຄໍາສັ່ງ, GTK+
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Python, PHP
ປະເພດ
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/snowyowl/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
