ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ SuRankCo ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ surankco_r5.tar.gz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີສໍາລັບບ່ອນເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ SuRankCo ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
SuRankCo
Ad
ລາຍລະອຽດ
SuRankCo ເປັນຊອຟແວການຮຽນຮູ້ເຄື່ອງຈັກເພື່ອຄະແນນແລະຈັດອັນດັບ contigs ຈາກ de novo ປະກອບຂອງຂໍ້ມູນລໍາດັບການຜະລິດຕໍ່ໄປ. ມັນຝຶກອົບຮົມກັບການຈັດລຽງຂອງ contigs ກັບ genome ອ້າງອິງທີ່ຮູ້ຈັກແລະຄາດຄະເນຄະແນນແລະການຈັດອັນດັບສໍາລັບ contigs ທີ່ບໍ່ມີ genome ອ້າງອີງທີ່ກ່ຽວຂ້ອງເທື່ອ.
ສໍາລັບລາຍລະອຽດເພີ່ມເຕີມກ່ຽວກັບ SuRankCo ແລະການເຮັດວຽກຂອງມັນ, ກະລຸນາເບິ່ງ
"SuRankCo: ການຈັດອັນດັບການເບິ່ງແຍງຂອງ Contigs ໃນ de novo Assemblies"
Mathias Kuhring, Piotr Wojtek Dabrowski, Andreas Nitsche ແລະ Bernhard Y. Renard
(http://www.biomedcentral.com/1471-2105/16/240/abstract)
ກະລຸນາສັງເກດ, ແນະນໍາໃຫ້ອ່ານເອກະສານແລະໄຟລ໌ readme.txt ກ່ອນທີ່ຈະໃຊ້ SuRankCo.
ອັບເດດເດືອນມິຖຸນາ 2015:
* ການປ່ຽນແປງເລັກນ້ອຍເພື່ອເຮັດໃຫ້ການສະຫນັບສະຫນູນ BAM.
ອັບເດດເດືອນກຸມພາ 2014:
* ເພີ່ມການສະຫນັບສະຫນູນສໍາລັບການປະກອບ FASTA / SAM ນອກເຫນືອໄປຈາກ ACE / FASTQ (QUAL).
ໝາຍເຫດ: ຄຸນສົມບັດຂອງເຄື່ອງປະກອບ FASTA/SAM ບໍ່ລວມເອົາ BaseCount, BaseSeqmentCount ແລະ ContigQualities ເທື່ອ.
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
ເສັ້ນຄໍາສັ່ງ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Java, S/R
ປະເພດ
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/surankco/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
