ນີ້ແມ່ນແອັບ Windows ທີ່ມີຊື່ວ່າ BLAST Ring Image Generator ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ BRIG-0.95-dist.zip. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ BLAST Ring Image Generator ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ emulator ອອນ ໄລ ນ ໌ OS OnWorks ຈາກ ເວັບ ໄຊ ທ ໌ ນີ້, ແຕ່ ດີກ ວ່າ Windows ອອນ ໄລ ນ ໌ emulator.
- 5. ຈາກ OnWorks Windows OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກແລະຕິດຕັ້ງມັນ.
- 7. ດາວໂຫລດ Wine ຈາກບ່ອນເກັບມ້ຽນຊອບແວການແຈກຢາຍ Linux ຂອງທ່ານ. ເມື່ອຕິດຕັ້ງແລ້ວ, ທ່ານສາມາດຄລິກສອງຄັ້ງ app ເພື່ອດໍາເນີນການໃຫ້ເຂົາເຈົ້າກັບ Wine. ນອກນັ້ນທ່ານຍັງສາມາດລອງ PlayOnLinux, ການໂຕ້ຕອບທີ່ແປກປະຫຼາດໃນໄລຍະ Wine ທີ່ຈະຊ່ວຍໃຫ້ທ່ານຕິດຕັ້ງໂປລແກລມ Windows ແລະເກມທີ່ນິຍົມ.
ເຫຼົ້າແວງເປັນວິທີການແລ່ນຊອບແວ Windows ໃນ Linux, ແຕ່ບໍ່ມີ Windows ທີ່ຕ້ອງການ. ເຫຼົ້າແວງແມ່ນຊັ້ນຄວາມເຂົ້າກັນໄດ້ຂອງ Windows ແຫຼ່ງເປີດທີ່ສາມາດເອີ້ນໃຊ້ໂຄງການ Windows ໂດຍກົງໃນ desktop Linux ໃດກໍໄດ້. ໂດຍພື້ນຖານແລ້ວ, Wine ກໍາລັງພະຍາຍາມປະຕິບັດໃຫມ່ຢ່າງພຽງພໍຂອງ Windows ຕັ້ງແຕ່ເລີ່ມຕົ້ນເພື່ອໃຫ້ມັນສາມາດດໍາເນີນການຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ Windows ທັງຫມົດໄດ້ໂດຍບໍ່ຕ້ອງໃຊ້ Windows.
ພາບຫນ້າຈໍ:
ຜູ້ຜະລິດຮູບພາບວົງ BLAST
DESCRIPTION:
BRIG ເປັນແອັບພລິເຄຊັນຂ້າມແພລດຟອມ (Windows/Mac/Unix) ທີ່ສາມາດສະແດງການປຽບທຽບແບບວົງກົມລະຫວ່າງ genomes ຈໍານວນຫລາຍ, ໂດຍເນັ້ນໃສ່ການຈັດການຂໍ້ມູນການປະກອບ genome.ກະລຸນາອ້າງເຖິງເຈ້ຍ BRIG ຖ້າ BRIG ຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອສ້າງຕົວເລກສໍາລັບສິ່ງພິມ: NF Alikhan, NK Petty, NL Ben Zakour, SA Beatson (2011) BLAST Ring Image Generator (BRIG): ການປຽບທຽບ genome prokaryote ງ່າຍໆ, BMC Genomics, 12:402. PMID: 21824423
ຄຸນລັກສະນະ
- ຮູບພາບສະແດງໃຫ້ເຫັນຄວາມຄ້າຍຄືກັນລະຫວ່າງລໍາດັບການອ້າງອິງກາງແລະລໍາດັບອື່ນໆທີ່ເປັນວົງແຫວນທີ່ຕັ້ງໄວ້.
- BRIG ຈະປະຕິບັດການປຽບທຽບ BLAST ທັງໝົດ ແລະການວິເຄາະໄຟລ໌ໂດຍອັດຕະໂນມັດຜ່ານ GUI ງ່າຍໆ.
- ຂອບເຂດ contig ແລະການຄຸ້ມຄອງການອ່ານສາມາດສະແດງໄດ້ສໍາລັບ genomes ຮ່າງ; ກຣາຟແລະຄໍາບັນຍາຍທີ່ກໍາຫນົດເອງສາມາດສະແດງໄດ້.
- ການນໍາໃຊ້ຊຸດ genes ທີ່ກໍານົດໂດຍຜູ້ໃຊ້ເປັນການປ້ອນຂໍ້ມູນ, BRIG ສາມາດສະແດງການມີ gene, ບໍ່ມີ, ການຕັດອອກຫຼືການປ່ຽນແປງລໍາດັບໃນຊຸດຂອງ genomes ຄົບຖ້ວນ, genomes ສະບັບຮ່າງຫຼືແມ້ກະທັ້ງວັດຖຸດິບ, unassembled ຂໍ້ມູນລໍາດັບ.
- BRIG ຍັງຍອມຮັບໄຟລ໌ແຜນທີ່ການອ່ານທີ່ມີຮູບແບບ SAM ທີ່ເຮັດໃຫ້ພາກພື້ນ genomic ທີ່ມີຢູ່ໃນຂໍ້ມູນລໍາດັບທີ່ບໍ່ໄດ້ປະກອບມາຈາກຫຼາຍຕົວຢ່າງເພື່ອປຽບທຽບພ້ອມກັນ.
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Java
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/brig/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.