ນີ້ແມ່ນແອັບ Windows ທີ່ມີຊື່ວ່າ GenomeRunner ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ GenomeRunner-v4.0-Setup.zip. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີສໍາລັບບ່ອນເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ GenomeRunner ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ emulator ອອນ ໄລ ນ ໌ OS OnWorks ຈາກ ເວັບ ໄຊ ທ ໌ ນີ້, ແຕ່ ດີກ ວ່າ Windows ອອນ ໄລ ນ ໌ emulator.
- 5. ຈາກ OnWorks Windows OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກແລະຕິດຕັ້ງມັນ.
- 7. ດາວໂຫລດ Wine ຈາກບ່ອນເກັບມ້ຽນຊອບແວການແຈກຢາຍ Linux ຂອງທ່ານ. ເມື່ອຕິດຕັ້ງແລ້ວ, ທ່ານສາມາດຄລິກສອງຄັ້ງ app ເພື່ອດໍາເນີນການໃຫ້ເຂົາເຈົ້າກັບ Wine. ນອກນັ້ນທ່ານຍັງສາມາດລອງ PlayOnLinux, ການໂຕ້ຕອບທີ່ແປກປະຫຼາດໃນໄລຍະ Wine ທີ່ຈະຊ່ວຍໃຫ້ທ່ານຕິດຕັ້ງໂປລແກລມ Windows ແລະເກມທີ່ນິຍົມ.
ເຫຼົ້າແວງເປັນວິທີການແລ່ນຊອບແວ Windows ໃນ Linux, ແຕ່ບໍ່ມີ Windows ທີ່ຕ້ອງການ. ເຫຼົ້າແວງແມ່ນຊັ້ນຄວາມເຂົ້າກັນໄດ້ຂອງ Windows ແຫຼ່ງເປີດທີ່ສາມາດເອີ້ນໃຊ້ໂຄງການ Windows ໂດຍກົງໃນ desktop Linux ໃດກໍໄດ້. ໂດຍພື້ນຖານແລ້ວ, Wine ກໍາລັງພະຍາຍາມປະຕິບັດໃຫມ່ຢ່າງພຽງພໍຂອງ Windows ຕັ້ງແຕ່ເລີ່ມຕົ້ນເພື່ອໃຫ້ມັນສາມາດດໍາເນີນການຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ Windows ທັງຫມົດໄດ້ໂດຍບໍ່ຕ້ອງໃຊ້ Windows.
ໜ້າ ຈໍ
Ad
GenomeRunner
ລາຍລະອຽດ
ຫມາຍເຫດ: ສະບັບນີ້ຕ້ອງການໄຟລ໌ຖານຂໍ້ມູນ SQLite ເພີ່ມເຕີມ. ຕິດຕໍ່ຜູ້ພັດທະນາເພື່ອຂໍພວກມັນ.
ການນໍາໃຊ້ http://www.integrativegenomics.org/ ສໍາລັບຂໍ້ມູນຫຼ້າສຸດແລະການວິເຄາະ.
GenomeRunner ເປັນເຄື່ອງມືສໍາລັບການຂຸດຄົ້ນ genome ອັດຕະໂນມັດ. ມັນປະຕິບັດການວິເຄາະຄໍາອະທິບາຍແລະການປັບປຸງຂອງພາກພື້ນ genomic ທີ່ຜູ້ໃຊ້ສະຫນອງໃຫ້ (SNPs, Chip-seq ສະຖານທີ່ຜູກມັດແລະອື່ນໆ) ຕໍ່ກັບ > 6,000 (genome ຂອງມະນຸດ) ລັກສະນະ epigenomic ທີ່ມີຢູ່ໃນຕົວທ່ອງເວັບຂອງ genome UCSC.
ການປ້ອນຂໍ້ມູນ - ຂໍ້ມູນທັງໝົດຂອງ genome ໃນຮູບແບບ .bed (ໄຟລ໌ຂໍ້ຄວາມທີ່ຂັ້ນດ້ວຍແຖບທີ່ມີ chrom, chromStart, chromEnd).
ຜົນໄດ້ຮັບການວິເຄາະບັນທຶກ - ຄໍາບັນຍາຍລະອຽດຂອງແຕ່ລະພາກພື້ນ genomic ໃນຂໍ້ມູນການປ້ອນຂໍ້ມູນ. ໃຊ້ເພື່ອຈັດລໍາດັບຄວາມສໍາຄັນຂອງພາກພື້ນ genomic ຂອງບຸກຄົນໂດຍຈໍານວນທັງຫມົດຂອງລັກສະນະ epigenomic ເຂົາເຈົ້າຮ່ວມທ້ອງຖິ່ນກັບ.
ຜົນຜະລິດການວິເຄາະການເສີມສ້າງ - p-values of statisticically co-localizations of input-wide genome data with genome annotation features selected for the analysis. ໃຊ້ເພື່ອຈັດລໍາດັບຄວາມສໍາຄັນຂອງລັກສະນະ epigenomic ທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບຂໍ້ມູນຜູ້ໃຊ້.
ຄຸນລັກສະນະ
- ການວິເຄາະເຂດພັນທຸກໍາ (ChIP-seq, RNA-seq, DNA methylation, SNPs/CNVs ແລະອື່ນໆ)
- ເຂົ້າລະຫັດຂໍ້ມູນ
- ການວິເຄາະຄໍາອະທິບາຍແລະການປັບປຸງ
- ຮູບແບບໄຟລ໌ BED (chrom, chromStart, chromEnd)
- ພາບລວມວິດີໂອ (http://youtu.be/v9p9FClrqXU)
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ, ຜູ້ໃຊ້ສຸດທ້າຍ/ເດັສທັອບ
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
ໂຄງການແມ່ນລະບົບການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້ (UI).
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Visual Basic. ສຸດທິ
ສະພາບແວດລ້ອມຖານຂໍ້ມູນ
SQL ທີ່ອີງໃສ່
ປະເພດ
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/genomerunner/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
