bp_fastam9_to_tablep - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനായി

പട്ടിക:

NAME

fastm9_to_table - FASTA -m 9 ഔട്ട്‌പുട്ട് NCBI -m 9 ടാബുലാർ ഔട്ട്‌പുട്ടാക്കി മാറ്റുക

സിനോപ്സിസ്

fastm9_to_table [-e evaluefilter] [-b bitscorefilter] [--header] [-o outfile] inputfile1 inputfile2 ...

വിവരണം

കമാൻഡ് ലൈൻ ഓപ്ഷനുകൾ:
-e/--evaue evalue -- മൂല്യനിർണയം അനുസരിച്ച് ഫിൽട്ടർ ചെയ്യുക
-b/--ബിറ്റ്‌സ്‌കോർ ബിറ്റ്‌സ്‌കോർ -- ബിറ്റ്‌സ്‌കോർ പ്രകാരം ഫിൽട്ടർ ചെയ്യുക
--ഹെഡർ -- കോളം ഹെഡർ പ്രിന്റ് ചെയ്യാൻ ബൂളിയൻ ഫ്ലാഗ്
-o/--out -- ഡാറ്റ എഴുതുന്നതിനുള്ള ഓപ്ഷണൽ ഔട്ട്പുട്ട് ഫയൽ,
അല്ലെങ്കിൽ STDOUT-ലേക്ക് എഴുതും
-h/--help -- ഈ ഡോക്യുമെന്റേഷൻ കാണിക്കുക

സാങ്കേതികമായി ഒരു SearchIO സ്ക്രിപ്റ്റ് അല്ല, കാരണം ഇത് Bioperl ഘടകങ്ങളൊന്നും ഉപയോഗിക്കുന്നില്ല, എന്നാൽ a
ഉപയോഗപ്രദവും വേഗതയേറിയതും. സ്റ്റാൻഡേർഡ് NCBI -m9 നിരകളുള്ള പട്ടിക ഔട്ട്പുട്ടാണ് ഔട്ട്പുട്ട്.

ചോദ്യനാമം
ഹിറ്റ് പേര്
ശതമാനം ഐഡന്റിറ്റി
വിന്യാസ ദൈർഘ്യം
സംഖ്യ പൊരുത്തക്കേടുകൾ
സംഖ്യ വിടവുകൾ
അന്വേഷണ ആരംഭം (റെവ്-സ്‌ട്രാൻഡ് ആരംഭം > അവസാനത്തിലാണെങ്കിൽ)
ചോദ്യം അവസാനം
ആരംഭം അമർത്തുക (റെവ്-സ്ട്രാൻഡ് സ്റ്റാർട്ട് > എൻഡ് ആണെങ്കിൽ)
ഹിറ്റ് എൻഡ്
വിലയിരുത്തുക
ബിറ്റ് സ്കോർ

കൂടാതെ 3 കോളങ്ങൾ കൂടി നൽകിയിട്ടുണ്ട്
ഫാസ്റ്റ സ്കോർ
sw-സ്കോർ
ശതമാനം സമാനമാണ്
അന്വേഷണ ദൈർഘ്യം
ഹിറ്റ് നീളം
അന്വേഷണ വിടവുകൾ
വിടവുകൾ അടിക്കുക

AUTHOR - ജേസൺ സ്റ്റാജിച്ച്

ജേസൺ സ്റ്റാജിച്ച് jason_at_bioperl-dot-org

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് ഓൺലൈനായി bp_fastam9_to_tablep ഉപയോഗിക്കുക