Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്‌സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാൻ കഴിയുന്ന bp_sreformatp കമാൻഡ് ആണിത്.
പട്ടിക:
NAME
bpsreformat - സീക്വൻസ് ഫോർമാറ്റുകൾ പരിവർത്തനം ചെയ്യുക
വിവരണം
ഈ സ്ക്രിപ്റ്റ് സീക്വൻസ് ഫോർമാറ്റുകൾ പരിവർത്തനം ചെയ്യാൻ അനുവദിക്കുന്ന SeqIO സിസ്റ്റം ഉപയോഗിക്കുന്നു
സീക്വൻസ് ഡാറ്റ അല്ലെങ്കിൽ മൾട്ടിപ്പിൾ സീക്വൻസ് അലൈൻമെന്റ് ഡാറ്റ. സീൻ എന്ന വസ്തുതയിൽ നിന്നാണ് ഈ പേര് വന്നത്
എഡിയുടെ പ്രോഗ്രാം sreformat (HMMER pkg യുടെ ഭാഗം) ഇതിനകം ഇത് ചെയ്യുന്നു. സീനിന്റെ പ്രോഗ്രാം ശ്രമിക്കുന്നു
ഞങ്ങളുടെ കോഡിലായിരിക്കുമ്പോൾ ഇൻപുട്ട് ഫോർമാറ്റുകൾ ഊഹിക്കാൻ ഞങ്ങൾ നിലവിൽ നിങ്ങളോട് എന്താണെന്ന് വ്യക്തമാക്കേണ്ടതുണ്ട്
ഇൻപുട്ട്, ഔട്ട്പുട്ട് ഫോർമാറ്റുകൾ, ഡാറ്റ ഒരു മൾട്ടിപ്പിൾ സീക്വൻസ് അലൈൻമെന്റിൽ നിന്നോ അതിൽ നിന്നോ ആണെങ്കിൽ
നേരിട്ടുള്ള ക്രമത്തിലുള്ള ഫയലുകൾ.
ഉപയോഗം:
bpsreformat -if INFORMAT -of OUTFORMAT -i FILENAME -o output.FORMAT
-h/--help ഈ സഹായം അച്ചടിക്കുക
-if/--informat ഇൻപുട്ട് ഫോർമാറ്റ് വ്യക്തമാക്കുക
-of/--outformat ഔട്ട്പുട്ട് ഫോർമാറ്റ് വ്യക്തമാക്കുക
-i/--input ഇൻപുട്ട് ഫയലിന്റെ പേര് വ്യക്തമാക്കുക
(STDIN-ൽ ഡാറ്റ കൈമാറാൻ ഫയൽനാമമായി മൈനസ് ചിഹ്നം ഉപയോഗിക്കുക)
-o/--output ഔട്ട്പുട്ട് ഫയലിന്റെ പേര് വ്യക്തമാക്കുക
(STDOUT-ൽ ഡാറ്റ കൈമാറാൻ ഫയൽനാമമായി മൈനസ് ചിഹ്നം ഉപയോഗിക്കുക)
--msa ഇത് മൾട്ടിപ്പിൾ സീക്വൻസ് അലൈൻമെന്റ് ഡാറ്റയാണെന്ന് വ്യക്തമാക്കുക
--special പ്രത്യേക പാരാമീറ്ററുകൾ AlignIO/SeqIO-ലേക്ക് കൈമാറും
ഒബ്‌ജക്റ്റ് -- ഇവയിൽ മിക്കതും ബയോ:: അലൈൻ ഐഒ ഒബ്‌ജക്റ്റുകൾക്കുള്ളതാണ്
ഇനിപ്പറയുന്നവയുടെ കോമയാൽ വേർതിരിച്ച ലിസ്റ്റ്
noninterleaved -- phylip, non-interleaved ഫോർമാറ്റിന്
idlinebreak -- phylip-ന്, അതിനെ മോൾഫി ഫോർമാറ്റ് ആക്കുന്നു
ശതമാനം -- clustalw ന്, ഓരോ വരിയിലും % ഐഡി കാണിക്കുക
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് bp_sreformatp ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക
