dicomtonifti - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

dicomtonifti - vtk-dicom CLI

വിവരണം

ഉപയോഗം:
dicomtonifti -o file.nii file1.dcm [file2.dcm ...]

dicomtonifti -o ഡയറക്ടറി --ബാച്ച് file1.dcm [file2.dcm ...]

ഓപ്ഷനുകൾ:
-o
ഔട്ട്പുട്ട് ഫയൽ (അല്ലെങ്കിൽ ഡയറക്ടറി, എങ്കിൽ --ബാച്ച്).

-z --കംപ്രസ് ചെയ്യുക
ഔട്ട്പുട്ട് ഫയലുകൾ കംപ്രസ് ചെയ്യുക.

-r --ആവർത്തനം
ഉപഡയറക്‌ടറികളിലേക്ക് ആവർത്തിക്കുക.

-b --ബാച്ച്
ഒരേസമയം ഒന്നിലധികം പരമ്പരകൾ ചെയ്യുക.

-s --നിശബ്ദത
ഔട്ട്‌പുട്ട് ഫയൽനാമങ്ങൾ പ്രതിധ്വനിപ്പിക്കരുത്.

-v --വാക്കുകൾ
വെർബോസ് പിശക് റിപ്പോർട്ടിംഗ്.

-L --ഫോളോ-സിംലിങ്കുകൾ
ആവർത്തിക്കുമ്പോൾ പ്രതീകാത്മക ലിങ്കുകൾ പിന്തുടരുക.

--fsl FSL-ൽ ഉപയോഗിക്കുന്നതിന് അക്ഷീയ ചിത്രം ഫോർമാറ്റ് ചെയ്യുക.

--reformat-to-axial
ചിത്രം അക്ഷീയ ഓറിയന്റേഷനിലേക്ക് റീഫോർമാറ്റ് ചെയ്യുക.

--നോ-സ്ലൈസ്-പുനഃക്രമീകരിക്കൽ
കഷ്ണങ്ങൾ ഒരിക്കലും പുനഃക്രമീകരിക്കരുത്.

--നോ-വരി-പുനഃക്രമീകരിക്കൽ
ഒരിക്കലും വരികൾ പുനഃക്രമീകരിക്കരുത്.

--നോ-നിര-പുനഃക്രമീകരിക്കൽ
നിരകൾ ഒരിക്കലും പുനഃക്രമീകരിക്കരുത്.

പുനഃക്രമീകരിക്കുന്നില്ല
സ്ലൈസുകളോ വരികളോ നിരകളോ ഒരിക്കലും പുനഃക്രമീകരിക്കരുത്.

--no-qform
NIFTI ഫയലിൽ ഒരു qform ഉൾപ്പെടുത്തരുത്.

--നോ-സ്ഫോം
NIFTI ഫയലിൽ ഒരു സ്‌ഫോം ഉൾപ്പെടുത്തരുത്.

--വ്യാപ്തം N
വോളിയം ഔട്ട്പുട്ടിലേക്ക് സജ്ജമാക്കുക (0-ൽ ആരംഭിക്കുന്നു).

--പതിപ്പ്
പതിപ്പ് പ്രിന്റ് ചെയ്ത് പുറത്തുകടക്കുക.

--ബിൽഡ്-പതിപ്പ്
ഉറവിടം അച്ചടിക്കുക, പതിപ്പ് നിർമ്മിക്കുക.

--സഹായിക്കൂ ഡികോംടോണിഫ്റ്റിക്കുള്ള ഡോക്യുമെന്റേഷൻ.

ഈ പ്രോഗ്രാം ഒരു DICOM സീരീസ് ഒരു NIFTI ഫയലാക്കി മാറ്റും.

ഇത് DICOM പൊസിഷനും ഓറിയന്റേഷൻ മെറ്റാഡാറ്റയും വായിക്കുകയും ഈ വിവരങ്ങൾ ഉപയോഗിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു
NIFTI തലക്കെട്ടിനായി qform, sform എൻട്രികൾ സൃഷ്ടിക്കുക, അതിൽ നിന്ന് ഒരു പരിവർത്തനം നടത്തിയ ശേഷം
DICOM കോർഡിനേറ്റ് സിസ്റ്റം NIFTI കോർഡിനേറ്റ് സിസ്റ്റത്തിലേക്ക്.

ഡിഫോൾട്ടായി, അത് ചിത്രത്തിന്റെ നിരകൾ പുനഃക്രമീകരിക്കുകയും ചെയ്യും, അങ്ങനെ ഉയർന്ന കോളങ്ങൾ
സൂചികകൾ രോഗിയുടെ വലതുവശത്താണ് (അല്ലെങ്കിൽ സഗിറ്റൽ ചിത്രങ്ങളുടെ കാര്യത്തിൽ, കൂടുതൽ
മുൻഭാഗം). അതുപോലെ, ഉയർന്ന സൂചികകളുള്ള വരികൾ പുനഃക്രമീകരിക്കും
മികച്ചത് (അല്ലെങ്കിൽ അച്ചുതണ്ട് ചിത്രങ്ങൾക്ക് മുൻഭാഗം). അവസാനമായി, അത് സ്ലൈസുകൾ പുനഃക്രമീകരിക്കും അങ്ങനെ
നിരയുടെ ദിശ, വരി ദിശ, സ്ലൈസ് ദിശ എന്നിവ വലതുവശത്തുള്ള നിയമം പിന്തുടരുന്നു.

വഴി അക്ഷീയ ഓറിയന്റേഷനിലേക്ക് ചിത്രങ്ങൾ റീഫോർമാറ്റ് ചെയ്യാനും സാധിക്കും
--reformat-to-axial ഓപ്‌ഷൻ ഈ ഓപ്‌ഷൻ പുനഃക്രമീകരിക്കാതെ പരസ്പരവിരുദ്ധമാണ്
ഓപ്ഷനുകൾ. തത്ഫലമായുണ്ടാകുന്ന ഓറിയന്റേഷൻ മാട്രിക്സ് ഐഡന്റിറ്റി മെട്രിക്സ് ആയിരിക്കും.

ഔട്ട്പുട്ട് NIFTI ഫയലുകൾ FMRIB FSL പാക്കേജിനൊപ്പം ഉപയോഗിക്കണമെങ്കിൽ, ഉപയോഗിക്കുക --fsl
സ്റ്റാൻഡേർഡ് എഫ്എസ്എൽ ഓറിയന്റേഷനുമായി പൊരുത്തപ്പെടുന്നതിന് ഇമേജുകൾ റീഫോർമാറ്റ് ചെയ്യുന്നതിനുള്ള ഓപ്ഷൻ: അക്ഷീയ ഇമേജുകൾ
സ്ലൈസുകൾ താഴ്ന്നതിൽ നിന്ന് ഉയർന്നതിലേക്ക് ക്രമീകരിച്ചിരിക്കുന്നു, കോളം നമ്പർ വലത്തുനിന്ന് ഇടത്തേക്ക് വർദ്ധിക്കുന്നു,
കൂടാതെ വരികളുടെ എണ്ണം പിൻഭാഗത്ത് നിന്ന് മുൻഭാഗത്തേക്ക് വർദ്ധിക്കുന്നു. ഇത് ഡാറ്റയും പരിവർത്തനം ചെയ്യും
ആവശ്യമെങ്കിൽ സൈൻ ചെയ്യാത്ത 16-ബിറ്റ് മുതൽ സൈൻ ചെയ്ത 16-ബിറ്റ് വരെ ടൈപ്പ് ചെയ്യുക.

ബാച്ച് മോഡ് തിരഞ്ഞെടുത്തിട്ടുണ്ടെങ്കിൽ, "-o" ഉപയോഗിച്ച് നൽകിയിരിക്കുന്ന ഔട്ട്പുട്ട് ഫയൽ DICOM-ൽ നിന്ന് നിർമ്മിക്കാവുന്നതാണ്
ആട്രിബ്യൂട്ടുകൾ, ചുരുണ്ട ബ്രേസുകൾക്കുള്ളിൽ ആട്രിബ്യൂട്ട് പേരുകൾ നൽകുന്നതിലൂടെ. ഉദാഹരണത്തിന്, പരിഗണിക്കുക
ഇനിപ്പറയുന്നവ: "{PatientID}-{StudyDate}/{SeriesDescription}-{SeriesNumber}.nii" അല്ലെങ്കിൽ
ഒരു ഹൈറാർക്കിക്കൽ ഡയറക്ടറി ഘടന നിർമ്മിക്കുന്നതിന് സമാനമായ ഒന്ന്. ഉപയോഗിക്കുന്ന ആട്രിബ്യൂട്ടുകൾ
പാത ഇനിപ്പറയുന്ന പട്ടികയിൽ നിന്നായിരിക്കണം:

രോഗി ഐഡി, രോഗിയുടെ പേര്, രോഗിയുടെ ജനനത്തീയതി, രോഗി ലൈംഗികത, പഠന ഐഡി, പഠനവിവരണം,
പഠനതീയതി, പഠനസമയം, സ്റ്റഡിഇൻസ്‌റ്റൻസ് യുഐഡി, സീരീസ് നമ്പർ, സീരീസ് വിവരണം,
SeriesInstanceUID, മോഡാലിറ്റി, പ്രവേശന നമ്പർ.

സബ്ഡയറക്‌ടറികളിലേക്ക് ആവർത്തിച്ച് കംപ്രസ് ചെയ്യുന്ന ബാച്ച് മോഡിന്റെ ഒരു ഉദാഹരണം ഇതാ
ഔട്ട്‌പുട്ട് ഫയലുകൾ, നിലവിലെ ഡയറക്‌ടറിയിൽ ഫലങ്ങൾ ഇടുന്നു:

./obj-x86_64-linux-gnu/bin/dicomtonifti -brz -o {SeriesDescription}-{SeriesNumber}.nii
/path/to/dicom/files

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് dicomtonifti ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക