gt-seqmutate - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

gt-seqmutate - തന്നിരിക്കുന്ന സീക്വൻസ് ഫയലിന്റെ(കളുടെ) സീക്വൻസുകൾ മ്യൂട്ടേറ്റ് ചെയ്യുക.

സിനോപ്സിസ്

gt seqmutate [ഓപ്ഷൻ ...] [sequence_file ...]

വിവരണം

-റേറ്റ് ചെയ്യുക [മൂല്യം]
മ്യൂട്ടേഷൻ നിരക്ക് സജ്ജീകരിക്കുക (ഡിഫോൾട്ട്: 1)

- വീതി [മൂല്യം]
ഫാസ്റ്റ സീക്വൻസ് പ്രിന്റിംഗിനായി ഔട്ട്പുട്ട് വീതി സജ്ജമാക്കുക (0 ഫോർമാറ്റിംഗ് പ്രവർത്തനരഹിതമാക്കുന്നു) (സ്ഥിരസ്ഥിതി: 0)

-o [ഫയലിന്റെ പേര്]
നിർദ്ദിഷ്ട ഫയലിലേക്ക് ഔട്ട്പുട്ട് റീഡയറക്ട് ചെയ്യുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി: നിർവചിക്കാത്തത്)

-ജിസിപ്പ് [അതെ|ഇല്ല]
gzip കംപ്രസ് ചെയ്ത ഔട്ട്‌പുട്ട് ഫയൽ എഴുതുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഇല്ല)

-bzip2 [അതെ|ഇല്ല]
bzip2 കംപ്രസ് ചെയ്ത ഔട്ട്പുട്ട് ഫയൽ എഴുതുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഇല്ല)

-ശക്തിയാണ് [അതെ|ഇല്ല]
ഔട്ട്‌പുട്ട് ഫയലിലേക്ക് എഴുതാൻ നിർബന്ധിക്കുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഇല്ല)

-ഹെൽപ്പ്
സഹായം പ്രദർശിപ്പിക്കുകയും പുറത്തുകടക്കുകയും ചെയ്യുക

-പതിപ്പ്
പതിപ്പ് വിവരങ്ങൾ പ്രദർശിപ്പിക്കുകയും പുറത്തുകടക്കുകയും ചെയ്യുക

തന്നിരിക്കുന്ന ശ്രേണികളിലെ ഓരോ സ്ഥാനത്തിനും അത് പ്രോബബിലിറ്റി ഉപയോഗിച്ച് ക്രമരഹിതമായി നിർണ്ണയിക്കപ്പെടുന്നു
(മ്യൂട്ടേഷൻ നിരക്ക് / 100) നൽകിയിരിക്കുന്ന സ്ഥാനം മ്യൂട്ടേറ്റ് ചെയ്താൽ. അങ്ങനെയെങ്കിൽ, 80% കേസുകളിലും എ
യഥാക്രമം 10% ഒരു ഇൻസെർഷനിലും 10% ഒരു ഇല്ലാതാക്കലിലും പകരക്കാരൻ നടത്തുന്നു. വേണ്ടി
പകരം വയ്ക്കൽ, ഉൾപ്പെടുത്തൽ ഇവന്റുകൾ, ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് പരിഗണിക്കാതെ ക്രമരഹിതമായി ജനറേറ്റുചെയ്യുന്നു
യഥാർത്ഥ ന്യൂക്ലിയോടൈഡ്. അതായത്, പുനർനിർമ്മാണങ്ങൾ സാധ്യമാണ്. ഈ നടപടിക്രമം തുല്യമാണ്
ഇനിപ്പറയുന്ന പേപ്പറിന്റെ 1867 പേജിൽ വിവരിച്ച ഒന്ന്:

ടി.ഡി. Wu ഒപ്പം സി.കെ. വതനാബെ. GMAP: a ജീനോമിക് മാപ്പിംഗ് ഒപ്പം വിന്യാസം പ്രോഗ്രാം വേണ്ടി mRNA ഒപ്പം EST
സീക്വൻസുകൾ. ബയോ ഇൻഫോർമാറ്റിക്സ്, 21(9):1859-1875, 2005.

റിപ്പോർട്ടുചെയ്യുന്നു ബഗുകൾ

ബഗുകൾ റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യുകgt-users@genometools.org>.

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് gt-seqmutate ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക