gt-tagerator - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

gt-tagerator - തന്നിരിക്കുന്ന ഇൻഡക്സിലെ ചെറിയ സീക്വൻസ് ടാഗുകൾ മാപ്പ് ചെയ്യുക.

സിനോപ്സിസ്

gt ടാഗറേറ്റർ [ഓപ്ഷനുകൾ] -ക്യു ടാഗ് ഫയൽ [-esa|-pck] സൂചികനാമം

വിവരണം

-q
ചെറിയ സീക്വൻസ് ടാഗുകൾ അടങ്ങിയ ഫയലുകൾ വ്യക്തമാക്കുക

-e [മൂല്യം]
അനുവദനീയമായ വ്യത്യാസങ്ങളുടെ എണ്ണം വ്യക്തമാക്കുക (മാറ്റിസ്ഥാപിക്കൽ/ഇൻസേർഷനുകൾ/ഇല്ലാതാക്കലുകൾ)

-എസ [സ്ട്രിംഗ്]
സൂചിക വ്യക്തമാക്കുക (മെച്ചപ്പെടുത്തിയ സഫിക്സ് അറേ) (ഡിഫോൾട്ട്: നിർവചിക്കാത്തത്)

-pck [സ്ട്രിംഗ്]
സൂചിക വ്യക്തമാക്കുക (പാക്ക് ചെയ്ത സൂചിക) (സ്ഥിരസ്ഥിതി: നിർവചിക്കാത്തത്)

-തലയാട്ടുക [അതെ|ഇല്ല]
നേരിട്ടുള്ള പൊരുത്തങ്ങൾ കണക്കാക്കരുത് (ഡിഫോൾട്ട്: ഇല്ല)

-ഇല്ല [അതെ|ഇല്ല]
പാലിൻഡ്രോമിക് പൊരുത്തങ്ങൾ കണക്കാക്കരുത് (അതായത് റിവേഴ്സ് കോംപ്ലിമെന്റഡ് പൊരുത്തങ്ങൾ ഇല്ല.) (സ്ഥിരസ്ഥിതി:
ഇല്ല)

- മികച്ചത് [അതെ|ഇല്ല]
മികച്ച പൊരുത്തങ്ങൾ മാത്രം കണക്കാക്കുക, അതായത് പൊരുത്തങ്ങളുള്ള ഏറ്റവും ചെറിയ എഡിറ്റ് ദൂരത്തിന് മാത്രം (സ്ഥിരസ്ഥിതി:
ഇല്ല)

-മാക്സോക്ക് [മൂല്യം]
പൊരുത്തമുള്ള സംഭവങ്ങളുടെ പരമാവധി എണ്ണം വ്യക്തമാക്കുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി: 0)

-skpp [അതെ|ഇല്ല]
പാറ്റേണിന്റെ പ്രിഫിക്‌സ് ഒഴിവാക്കുക (pdiff മോഡിൽ മാത്രം) (ഡിഫോൾട്ട്: ഇല്ല)

-വിത്ത് വൈൽഡ് കാർഡുകൾ [അതെ|ഇല്ല]
വൈൽഡ്കാർഡ് പ്രതീകങ്ങൾ അടങ്ങിയ ഔട്ട്പുട്ട് പൊരുത്തങ്ങൾ (ഉദാ N); ഏകദേശത്തിന് മാത്രം പ്രസക്തമാണ്
പൊരുത്തപ്പെടുത്തൽ (സ്ഥിരസ്ഥിതി: അതെ)

- ഔട്ട്പുട്ട്
ഔട്ട്‌പുട്ട് ടാഗ്നം ഷോ ഓർഡിനൽ നമ്പർ വ്യക്തമാക്കുന്നതിന് ഇനിപ്പറയുന്ന കീവേഡുകളുടെ സംയോജനം ഉപയോഗിക്കുക
ടാഗ് tagseq കാണിക്കുക ടാഗ് സീക്വൻസ് dblength കാണിക്കുന്ന പൊരുത്തത്തിന്റെ ദൈർഘ്യം ഡാറ്റാബേസിൽ dbstartpos
ഡാറ്റാബേസിൽ പൊരുത്തത്തിന്റെ ആരംഭ സ്ഥാനം കാണിക്കുക abspos dbstartpos-ന്റെ സമ്പൂർണ്ണ മൂല്യം കാണിക്കുന്നു
dbsequence show sequence of match strand ഷോ strand edist ഷോ എഡിറ്റ് ദൂരം
tagstartpos ടാഗിൽ മത്സരത്തിന്റെ ആരംഭ സ്ഥാനം കാണിക്കുന്നു (-maxocc-ന് മാത്രം) ടാഗ്ലെങ്ത് ഷോ
ടാഗിലെ പൊരുത്തത്തിന്റെ ദൈർഘ്യം (-maxocc-ന് മാത്രം) tagsuffixseq ഉൾപ്പെട്ടിരിക്കുന്ന സഫിക്സ് ടാഗ് കാണിക്കുക
പൊരുത്തം (-maxocc-ന് മാത്രം)

-v [അതെ|ഇല്ല]
വാചാലനായിരിക്കുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഇല്ല)

-ഹെൽപ്പ്
സഹായം പ്രദർശിപ്പിക്കുകയും പുറത്തുകടക്കുകയും ചെയ്യുക

-പതിപ്പ്
പതിപ്പ് വിവരങ്ങൾ പ്രദർശിപ്പിക്കുകയും പുറത്തുകടക്കുകയും ചെയ്യുക

റിപ്പോർട്ടുചെയ്യുന്നു ബഗുകൾ

ബഗുകൾ റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യുക[ഇമെയിൽ പരിരക്ഷിച്ചിരിക്കുന്നു]>.

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് gt-tagerator ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക