kmc_tools - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

kmc_tools - k-mer ഡാറ്റാബേസുകളിലെ അധിക പ്രവർത്തനങ്ങൾ

സിനോപ്സിസ്

kmc_tools [ആഗോള പാരാമീറ്ററുകൾ] [ഓപ്പറേഷൻ പാരാമീറ്ററുകൾ]

വിവരണം

ഈ കമാൻഡും അതിന്റെ വിവിധ ഉപകമൻറുകളും കെഎംസിയിൽ നിരവധി പ്രവർത്തനങ്ങൾ നടപ്പിലാക്കുന്നു
ഡാറ്റാബേസുകൾ.

k-mers സെറ്റുകൾ പ്രവർത്തനങ്ങൾ വേണ്ടി 2 കെ.എം.സി. ഡാറ്റാബേസുകൾ
വിഭജിക്കുക
2 k-mers സെറ്റുകളുടെ കവല

കിലോമീറ്ററുകൾ_ഒഴിവാക്കുക
2 k-mers സെറ്റുകളുടെ കുറയ്ക്കൽ

കൗണ്ടറുകൾ_ഒഴിവാക്കുക
2 k-mer സെറ്റുകളുടെ കൗണ്ടറുകൾ കുറയ്ക്കൽ

യൂണിയൻ
2 k-mers സെറ്റുകളുടെ യൂണിയൻ

പ്രവർത്തനങ്ങൾ വേണ്ടി സിംഗിൾ കി.മീ. ഡാറ്റാബേസ്
അടുക്കുക
KMC2.x സൃഷ്ടിച്ച ഡാറ്റാബേസിൽ നിന്ന് k-mers അടുക്കുന്നു

കുറയ്ക്കുക
വളരെ അപൂർവവും പതിവുള്ളതുമായ k-mers ഒഴിവാക്കുക

ഒതുക്കമുള്ള
കൗണ്ടറുകൾ നീക്കം ചെയ്യുക (കെ-മെറുകൾ മാത്രം സംഭരിക്കുക)

ഹിസ്റ്റോഗ്രാം
കെ-മേഴ്‌സ് സംഭവങ്ങളുടെ ഹിസ്റ്റോഗ്രാം

ഡംബ്
ടെക്സ്റ്റ് ഫയലിലേക്ക് k-mers ഉം കൗണ്ടറുകളും ഡംപ് ചെയ്യുക

കൂടുതൽ സങ്കീർണ്ണമായ പ്രവർത്തനങ്ങൾ:
സങ്കീർണ്ണമായ
നിരവധി ഇൻപുട്ട് ഡാറ്റാബേസുകളുള്ള സങ്കീർണ്ണമായ പ്രവർത്തനങ്ങൾ

മറ്റ് പ്രവർത്തനങ്ങൾ:
ഫിൽറ്റർ ചെയ്യുക
വളരെ ചെറിയ എണ്ണം k-mers ഉള്ള വായനകൾ ഫിൽട്ടർ ചെയ്യുക

ഓപ്ഷനുകൾ

ഗ്ലോബൽ പാരാമീറ്ററുകൾ:
-ടി
ആകെ ത്രെഡുകളുടെ എണ്ണം (ഡിഫോൾട്ട്: സിപിയു കോറുകളുടെ എണ്ണം)

-v
വെർബോസ് മോഡ് പ്രവർത്തനക്ഷമമാക്കുക (ചില വിവരങ്ങൾ കാണിക്കുന്നു) (സ്ഥിരസ്ഥിതി: തെറ്റ്)

-എച്ച്പി
ശതമാനം പുരോഗതി മറയ്ക്കുക (ഡിഫോൾട്ട്: തെറ്റ്)

ഉദാഹരണം

kmc_tools Union db1 -ci3 db2 -ci5 -cx300 db1_union_db2 -ci10

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് kmc_tools ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക